Mechanism of ligand access/egress to/from active site of microsomal drug-metabolising cytochromes P450
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P303-12-P019
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismus vstupu a výstupu látek do/z aktivního místa mikrosomálních cytochromů P450 při metabolizmu léčiv
Annotation in Czech
Mikrosomální cytochromy P450 (CYP) jsou enzymy, které se účastní metabolismu prvního průchodu cizorodých látek (xenobiotik) jako jsou např. léčiva či polutanty. Struktura CYP enzymů ukrývá zanořené aktivní místo, které je s okolním prostorem spojeno sítíkanálů sloužících jako vstupní případně výstupní cesty pro léčivo a jeho metabolit. Tyto kanály pak zřejmě hrají roli jak při určování substrátové specifity, tak také při kinetice CYP reakcí. Přes značný pokrok v identifikaci jednotlivých kanálů, stálenení jasný mechanismus jakým substráty vstupují do aktivního místa a produkty vystupují ven. Znalost těchto mechanismů by nám mohla napomoci při nových strategiích hledání léčiv, které berou ohled na ADMET vlastnosti léčiv. Tento projekt se zaměřuje na analýzu mechanismu vstupu a výstupu látek z/do CYP enzymů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FR - Pharmacology and apothecary chemistry
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30104 - Pharmacology and pharmacy
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New software tool MOLE 2.0 for the analysis of the channels in proteins was developed and integrated into bioinformatics database PDBsum. This tool was employed for channel analysis in cytochromes P450. Channels leading into the active site are frequentin proteins and it will help to understand enzyme selectivity. Results were published in 6 high quality papers (+ 1 in press).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
976 thou. CZK
Public financial support
976 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK