Binding of tumor suppressor protein p53 to DNA. Effect of DNA supercoling and protein postsynthetic modification
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykův onkologický ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vazba nádorového supresoru proteinu p53 na DNA. Vliv superhelicity DNA a postranslační modifikace proteinu.
Annotation in Czech
Navržený projekt je orientován na výzkum nádorového supresoru proteinu p53 a na otázky jeho vyzby na DNA. Výzkum tohoto klíčového proteinu je nezbytný pro pochopení jeho mnohonásobných funkcí v buňce a jeho úlohy při vývoji rakoviny. Navržené studie jsouzaměřeny na: (i) vliv postsyntetických modifikací na vazbu tohoto proteinu na DNA a zvláště na nadšroubovicovou DNA, (ii) vliv superhelikální hustoty DNA navazbu p53, (iii) vliv nadšroubovicového vinutí na sekvenčně-specifickou vazbu p53 na různé cílovésekvence obsažené v kovalentně uzavřených kroužcích plasmidové DNA, (iv) adsorpčně/desorpční vlastnosti krátkých peptidů p53, specificky fosforylovaných na biologicky významných zbytcích aminokyselin ve srovnání s nefosforylovanými peptidy. Domníváme se, že modelové studie adsorpce těchto peptidů na elektricky nabitých površích přispějí k lepšímu poznání vlastností komplexních molekul proteinu p53 i vlivu fosforylace na tyto vlastnosti a na vazbu p53 na DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
DNA binding of the tumor suppressor protein p53 is stimulated by DNA supercoiling both in sequence-specific and non-specific interactions; Specific roles are played by the central and C-terminal domains and posttranslational modification of the protein.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/AV0/AV05IA/U/N/5:3
Data delivery date
Sep 26, 2007
Finance
Total approved costs
4,874 thou. CZK
Public financial support
1,990 thou. CZK
Other public sources
2,884 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK