Structural basis for transcription termination of nonpolyadenylated transcripts
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA401630903
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní podstata mechanismu ukončení transkripce nepolyadenylovaných transkriptů
Annotation in Czech
RNA polymerázy produkují RNA transkripty pomocí iniciace a terminace transkripce které se odvíjejí od specifických sekvencí. Signály které řídí ukončení transkripce leží buď přímo v sekvenci DNA templátu, nebo v sekvenci vznikající RNA. RNA polymeráza IIpřepisuje nejen mRNA ale také malé jaderné či malé jadérkové RNA, mezigenové a "anti-sense" RNA. Ukončení těchto transkriptů vyžaduje komplex Nrd1 který rozeznává specifický sekvenční signál ve vznikajícím RNA transkriptu pomocí zatím neznámého mechanismu. Navrhujeme použít multidimenzionální NMR spektroskopii ke studiu strukturní podstaty rozpoznávání RNA komplexem Nrd1. Tento projekt také odhalí důležitost vzdálenosti a orientace terminačních elementů v RNA transkriptu, které vedou k účinné terminacitranskripce nezaložené na polyadenylačním signálu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The determined structures of protein-RNA and protein-protein complexes provide insights into poly(A)-independent transcription termination. The results are summarized in 5 papers published in peer-review journals and two more manuscripts were submitted.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
4,875 thou. CZK
Public financial support
4,875 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK