Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500220502
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce metabolických drah v komplexním plastidu rozsivky Thalassiosira pseudonana
Annotation in Czech
Rozsivky obsahujíá vícemembránový komplexní plastid. Ten vznikl během procesu označovaného jako sekundární endosymbióza, kdy byl jednobuněčný fotosyntetický eukaryot (v případě rozsivek červená řasa) pohlcen jiným jednobuněčným eukaryotem. V průběhu evoluce byl tento endosymbiont zredukován do podoby plastidu obaleného více než dvěmi membránami. Většina proteinů používaných v plastidu je jaderně kódována a posttranslačně importována do komplexního plastidu prostřednictvím dvojdílné importní sekvence. Předběžné analýzy genomu rozsivky ukazjjí, že metabolické druhy lokalizované v plastidu obsahují též enzymy jiného, než plastidového původu, Projekt je zaměřen na vyhledávání jaderných genů kódujících proteiny potenciálně targetované do plastidu rozsivek,in silico analýzu jejich targetovacích sekvencí a fylogenentickou analýzu. U některých vybraných negů, u kterých není z genomové sekvence možno specifikovat charakter targetovací sekvence, bude 5" - konec transkriptu určen pomocí 5" - RACE.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Origins and location of the enzymes of three pathways from the diatom complex plastid were studied: heme synthesis, shikimate pathway and synthesis of tryptophan. These pathways are mosaic, therefore location of the enzymes does not fit to their origins.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 1, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
1,264 thou. CZK
Public financial support
1,264 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK