All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Structural and functional characterization of the giant plant Ogre-like retrotransposons

Public support

  • Provider

    Academy of Sciences of the Czech Republic

  • Programme

    Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic

  • Call for proposals

    Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    IAA500960702

Alternative language

  • Project name in Czech

    Strukturní a funkční charakterizace gigantických rostlinných retrotranspozónů typu Ogre

  • Annotation in Czech

    Retrotranspozóny typu Ogre představují nově popsanou rodinu rostlinných retroelementů, pro kterou je charakteristická extrémní délka elementů (22-25 kb) a jejich specifická struktura. Tyto elementy vykazují v řadě studovaných druhů vysoký stupeň amplifikace a konzervovanosti svých sekvencí, a navíc jsou transkripčně aktivní, což naznačuje jejich recentní transpoziční aktivitu. Cílem navrhovaného projektu je provést detailní charakterizaci Ogre elementů, zaměřenou na variabilitu a strukturu jejich transkriptů a identifikaci odpovídajících regulačních sekvencí, studium čtecího rámce o neznámé funkci a srovnávací počítačovou analýzu elementů pocházejících z různých druhů. Výsledkem těchto analýz bude podrobná charakterizace Ogre elementů jako potenciálněnové skupiny rostlinných retrotranspozónů, a především příspěvek k objasnění molekulárních mechanismů umožňujících vysoce účinnou amplifikaci některých typů retrotranspozónů v genomech rostlin.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    This project yielded novel findings about structure and biology of Ogre elements and revealed their impact on genome architecture and evolution in many plant species.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2007

  • Realization period - end

    Dec 31, 2009

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 28, 2009

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP10-AV0-IA-U/01:1

  • Data delivery date

    Jun 8, 2010

Finance

  • Total approved costs

    2,272 thou. CZK

  • Public financial support

    2,272 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK