The role of Trypanosoma brucei RNA binding proteins in mitochondrial transcript processing.
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500960705
Alternative language
Project name in Czech
Úloha RNA vazebných proteinů podílejících se na úpravách mitochondriálních transkriptů u Trypanosoma brucei
Annotation in Czech
RNA metabolismus trypanosom má řadu jedinečných vlastností, například editování RNA pomocí inzercí a delecí U. Naše znalosti o mechanismu editování jsou poměrně detailní, zatímco proteiny, které nejsou součástí editosomu, ale podílejí se na editování čistabilitě mt RNA, jsou přehlížené. V současnosti jsme vyřešením krystalické struktury ukázali, že komplex proteinů MRP má schopnost spojovat dvě molekuly RNA. Předběžné údaje naznačují funkci proteinu TbRGG1 a REAP1 nejen při editování, ale rovněž i procesování RNA. Naším cílem je studium funkce těchto genů u Trypanosoma brucei za použití následujících přístupů: i/ vypnout vybrané geny pomocí RNA interference s cílem zjistit jejich funkci při editování a modifikacích RNA; ii/ vnést označené přirozené amutované verze těchto genů s cílem identifikovat vazebné partnery a studovat jejich vlastnosti; iii/ over-exprimovat tyto a nově identifikované proteiny pro jejich použití in vitro v RNA-vazebných esejích a ve strukturálních studiích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We have identified a novel complex of about 10 proteins named MRB1, and have established that its subunits are involved in guide RNA processing and mRNA stability. We also showed that T. evansi and T. equiperdum are petite mutants of Trypanosoma brucei.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
4,911 thou. CZK
Public financial support
4,911 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK