Functional analysis of candidate components of the RNA editing machinery in the flagellate Trypanosoma brucei
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)
Main participants
Parazitologický ústav AV ČR
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Funkční analýza vybraných proteinů účastnících se editování RNA u bičíkovce Trypanosoma brucei
Annotation in Czech
Trypanosoma brucei je původcem řady vážných chorob člověka a zvířat. Jednou z typických vlastností tohoto primitivního vičíkovce je rozsáhlá úprava poslíčkových RNA (mRNA) procesem editování v jeho mitochondrii. Řada proteinů, které jsou součástí tohotosložitého procesu nemá homology u vyšších eukaryot a představuje tudíž zajímavé farmakologické cíle. V rámci projektu budou připraveny linie buněk, u nichž budou metodou interference RNA vypnuty geny kódující guide RNA vážící proteiny 21 a 25, RNA na helikázu a RNA ligázu. Poté, co bude prokázána eliminace jmenovaných mRNA a proteinů, kterou způsobí in vivo syntetizovaná specifická dvouvláknová RNA, bude provedena charakterizace vzniklých fenotypů. Cílem této funkční analýzy je výrazně lepší pochopení složitéhoprocesu editování RNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We have shown that MRP1 and MRP2 proteins that bind gRNAs are essential for editing of RNA in Trypanosoma brucei. We have analyzed the function of nuclear-encoded subunits of respiratory complexes and proteins involved in FeS cluster assembly.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-IA-U/04:2
Data delivery date
Sep 26, 2007
Finance
Total approved costs
2,248 thou. CZK
Public financial support
1,838 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK