3-D studies of cells and their components: confocal microscopy applied to compare methods for measuring their geometrical characteristics
Project goals
The project aims at development and practical implementation of a new stereological method for length measurement having no reguirements on section orientation. Further, different methods for measuring geometrical characteristics will be compared, exploiting the opportunities provided by confocql microscopy. Theoretical and practical studies of efficiency of selected methods will be performed. In practical measurements, the surface area of cell walls in tobacco cell chains or grass leaf mesophyll cellsand the length of cytoskeletal structures of tobacco cells will be extimetd. The effect of technical limitations emerging during capturing images by a confocal microscope on the possible bias in surface area and length estimates will be studied. The possibilites of using a conventional optical microscope will be evaluated in comparison with a confocal microscope.
Keywords
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Trojrozměrné studie buněk a jejich komponent: použití konfokální mikroskopie pro srovnání metod měření jejich geometrických charakteristik
Annotation in Czech
Vyvinout a prakticky implementovat novou stereologickou metodu pro měření délky prostorových čar, nevyžadující náhodnou orientaci řezů. Dále budou porovnány různé metody pro měření geometických charakteristik s využitím možností, které nabízí konfokálnímikroskopie. Budou uskutečněny teoretické i praktické studie účinnosti vybraných metod. V praktických měřeních bude odhadován povrch buněčných stěn řetízků tabákových buněk či mezofylových buněk listů trav a délka cytoskeletálních struktur v tabákových buňkách. Bude rovněž studován vliv technických omezení, ke kterým dochází při snímání obrazů konfokálním mikroskopem, na chyby v odhadech povrchů a délek. Konečně budou posouzeny možnosti použití konvenčního optického mikroskopu ve srovnání s konfokálnímmikroskopem.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
JC - Computer hardware and software
CEP - another secondary branch
EF - Botany
10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
20206 - Computer hardware and architecture
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Vývoj a počítačová implementace nové stereologické metody pro odhad délky prostorové křivky (vlákna), založené na počítání průsečíků křivky se systémem virtuál.rovin. Metoda je přesná, účinná a obzvl.vhod.pro měř.délky kapilár s využ.konfok. mikroskopu.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/AV0/AV01IA/U/N/4:2
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
2,955 thou. CZK
Public financial support
1,303 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
2 955 CZK thou.
Public support
1 303 CZK thou.
0%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EA - Morphology and cytology
Solution period
01. 01. 1998 - 01. 01. 2000