Sequencing of the bovine herpesvirus-1 DNA

Provider

Academy of Sciences of the Czech Republic

Programme

Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic

Call for proposals

—

Main participants

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Sekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu)

Annotation in Czech

Navrhuje se účast v mezinárodním genomovém projektu s cílem stanovit úplnou nukleotidovou sekvenci genomu bovinního herpesviru 1 (BHV-1). BHV-1 je pathogen vyvolávající infekční rhinotracheitis s vážnými ekonomickými dopady. Genomový projekt je koordinován univerzitou v Zurichu a zůčastňuje se ho 15 laboratoří.DNA viru je bohatá na páry GC (74%), což činí sekvenaci obtížnou. Konstruovali jsme specializované vektory a vypracovali strategii pro sekvenaci DNA s extrémním složením bazí. Podmínky pro naši úspěšnou účast v tomto projektu jsou proto dobré. Selektované oblasti DNA budou parciálně štěpen restrikčním enzymeme HinPI a fragmenty budou klonovány s vektorem M13 linearizovaným AccI. Kontigy budou sestavovány pomocí programů GeneSkipper.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - secondary branch

—

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

Byl dokončen mezinár. gen. projekt "Genom bovinního herpesviru-1". V sekvenované DNA jsme identifikovali 71 genů a regulační elementy, které řídí expresi těchto genů. Ze všech zúč. laboratoří jsme k projektu přispěli nejvíce.

Realization period - beginning

Jan 1, 1997

Realization period - end

Jan 1, 1999

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3

Data delivery date

—

Total approved costs

1,272 thou. CZK

Public financial support

849 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK