Positional cloning of the Hybrid sterility 1 gene
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Poziční klonování genu Hybrid sterility 1
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je poziční klonování genu Hybrid sterility 1 (Hst1) a zahájení jeho molekulární a funkční charakterizace. Cíle bude dosaženo v šesti krocích, včetně fyzikálního mapování 1000 kb oblasti s genem Hst1, isolace P1 klonů a vytvoření jejich kontigu, hledání testis-specifických cDNA, které mapují do kritického YACu anebo P1 klonu a jejich mapování vzhledem k Hst1 lokusu. Kandidátní cDNA budou sekvenovány a budou hledány alelické rozdíly se stejnou distribucí mezi inbredními kmeny,jako mají sterilní a fertilní alely genu Hst1. Paralelně se sekvenačními experimenty budou připravovány transgenní myši s fragmentem genomové DNA (P1 klony) z oblasti Hst1 genu. Přítomnost Hst1 transgenu bude ověřena funkčním testem, fertilitou F1 hybridních samců s kmenem myšího druhu Mus m. musculus, PWB nebo PWD. Jiným funkčním důkazem bude cílená inaktivace kandidátního Hst1 genu a kombinace této mutace s transgenem s odlišnou alelou.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Zavedena technologie pozičního klonování vč. konstrukce YACových a BACových kontigů a transkripčního mapování. Určeno 5 kandidátních genů pro Hst1. Analyzována transkripce myších genů v kvasinkách, zjištěna konzervace syntenie od myši po bezobratlé.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1997
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3
Data delivery date
Jan 15, 2007
Finance
Total approved costs
3,604 thou. CZK
Public financial support
2,595 thou. CZK
Other public sources
1,326 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK