Epigenetic consequences of telomere dysfunction in Arabidopsis thaliana
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Epigenetické důsledky dysfunkce telomer u Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Telomery tvoří přirozené konce chromosomů, které zajišťují jejich replikaci i genomovou stabilitu. Říha et al. (Texas A&M University) zkonstruovali mutantní rostliny s deficiencí telomerázové aktivity. Tato mutace se projevuje postupným zkracováním telomer a následně i výraznými karyologickými a tenotypovými aberacemi vedoucími k terminální zástavě buněčného dělení i růstu. Histologická analýza aberantních fenotypů bude zaměřena na studium struktury apikálního meristému a exprese příslušných regulačníchgenů. Jelikož telomery představují významné elementy kotvící chromosomy k jaderné membráně somatických i meiotických buněk, budeme technikami 3-D in situ hybridizace a imunobarvení analyzovat prostorové a strukturní změny chromatinu v buňkách mutantů. Telomerová dysfunkce může způsobovat i epigenetické změny chromatinu. Sledováním exprese, modifikace histonů a metylace DNA selektovaných subtelomerických genů bude studován možný poziční (umlčovací) telomerový efekt.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EA - Morphology and cytology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We have analysed Arabidopsis plants and cell lines lacking telomerase activity. This knock-out led to telomere erosion. While the plants gradually died, the genome of cell lines was subject to large restructuralisations enabling cell survival.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-IA-U/03:3
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
6,361 thou. CZK
Public financial support
3,514 thou. CZK
Other public sources
2,098 thou. CZK
Non public and foreign sources
749 thou. CZK