Involvement of chromosomal protein HMG1 in DNA end joining by human DNA ligases
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vliv chromozomálního proteinu HMG1 na kovalentní spojování DNA působením lidských DNA ligáz
Annotation in Czech
HMG 1 představuje evolučně vysoce konzervovaný chromozomální protein s doposud neobjasněnou biologickou funkcí. Výsledky in vitro expreimentů však naznačují možnou funkci proteinu HMG 1 během DNA replikace, transkripce, rekombinace a reparace. Všechny tyto uvedené biologicky významné pochody využívají celou řadu enzymů z nichž významnou roli zaujímají DNA ligázy, které jsou nepostradatelné pro zachování integrity a stability genomu. Nedávno jsme zjistili, že HMG 1 významně stimuluje kovalentní spojováníkrátkých DNA duplexů vlivem T4 DNA ligázy (Štros M. (1998) J. Biol. Chem. 273, (an May issue) in press). Naše doposud nepublikované předběžné výsledky též naznačují, že HMG 1 rovněž stimuluje ligaci dvou DNA molekul vlivem lidské DNA ligázy I. Cílem projektu je studovat vliv HMG 1 a jiných "HMG box" proteinů na kovalentní spojování duplexů DNA působením lidských DNA ligáz I. III a IV a pokusit se o objasnění mechanismu. Experimenty budou prováděné s krátkými duplexy DNA s různou délkou konců.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Prokázali jsme,že HMGB1 stimuluje ligaci DNA prostř.B domény (T4 DNA ligáza).Metod.AFM (atomic force microscopy) a "pull-down" jsme zjis.,že stimul.vliv HMGB1 na lig.DNA je zřejmě důsl.schop. HMGB1 asociovat(nekovalentně)dva frag.DNA prostř.jejich konců.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3
Data delivery date
Jan 15, 2007
Finance
Total approved costs
3,016 thou. CZK
Public financial support
1,048 thou. CZK
Other public sources
1,868 thou. CZK
Non public and foreign sources
100 thou. CZK