Synthesis and evaluation of azaphthalocyanine derivatives as fluorescence quenchers
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB401100801
Alternative language
Project name in Czech
Syntéza a hodnocení azaftalocyaninů jako zhášečů fluorescence
Annotation in Czech
Předkládaný projekt si klade za cíl připravit a hodnotit novou skupinu zhášečů fluorescence pro značení biomolekul, zejména oligonukleotidových sond. Fluorescenční značení biomolekul je v současnosti velice rozšíření biomolekulární metoda detekce. Jednaz metod využívá dvě barviva ? jedno fluorescenční a druhé fungující jako zhášeč fluorescence. Tento projekt je zaměřen na syntézu a hodnocení zhášečů fluorescence pro fluorofory emitující (nejen) při vyšších vlnových délkách, kde v současné době stále zůstává stále problém s dostupnými zhášeči, zejména co se týče jejich chemické stability. Navržené struktury azaftalocyaninů (AzaPc), které dosud nebyly v této aplikaci nikdy použity, mají řadu velice výhodných vlastností pro tuto aplikaci a jsou chemickystabilní. Projekt řeší syntézu vhodných AzaPc i biomolekulární testy nových zhášečů použitím hybridizací značených oligonukleotidových sond. Obě možnosti zhášení fluorescence ? statické i dynamické zhášení (FRET) - budou testovány.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
New azaphthalocyanines were synthesized, attached to solid phase and labeled oligonucleotides were prepared. The oligonucleotides were introduced into DNA hybridization assays that confirmed high quenching efficiency with a range of fluorophores.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
2,327 thou. CZK
Public financial support
2,327 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK