Azaphthalocyanines – dark quenchers in DNA hybridization probes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Univerzita Karlova / Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-19094S
Alternative language
Project name in Czech
Azaftalocyaniny - nefluoreskující zhášeče pro DNA hybridizační sondy
Annotation in Czech
Tento projekt na pomezí chemie, fyziky a molekulární biologie je zaměřen na výzkum nových perspektivních nefluoreskujících zhášečů obsahujících azaftalocyaninové (AzaPc) jádro v DNA hybridizačních experimentech využívajících dvojitě značené sondy. AzaPc zhášeč je vhodný pro zhášení fluorescence prakticky všech v současnosti používaných fluoroforů. Většina tohoto projektu bude zaměřena na syntetické modifikace AzaPc jádra za účelem vyvinutí metodiky pro značení oligodeoxynukleotidových (ODN) sond na vybraných pozicích (včetně značení uvnitř řetězce) pomocí click chemie nebo pomocí AzaPc fosforamiditu. V některých experimentech zhášeč ponese i modifikaci zvyšující teplotu tání duplexu, např. interkalátory nebo látky vážící se do malého žlábku DNA. Očekáváme, že tento přístup povede ke zvýšení selektivity krátkých sond a k jejich lepšímu rozeznávání mutací v cílových DNA. Vyvinuté značící strategie umožní také výzkum vlivu značení ODN dvěma zhášeči (na 3-konci a uvnitř řetězce) na citlivost dlouhých sond.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 3, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/11:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
5,890 thou. CZK
Public financial support
5,890 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK