Study of Interactions in Complexes of HIV-1 protease with Inhibitors
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)
Main participants
Ústav makromolekulární chemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium interakcí v komplexech HIV-1 proteázy s inhibitory
Annotation in Czech
Náplní projektu je studium interakcí v komplexech HIV-1 proteázy s inhibitory. Projekt svou tématikou navazuje na již dříve dosažené výsledky, kdy na našem pracovišti bylo v rámci grantu AV ČR A4050811 (1998-2001) pomocí rentgenové strukturní analýzy vyřešeno několik struktur inhibovaných HIV proteáz. Experimentální materiál o struktuře získaný během tohoto projektu představuje významnou část současných znalostí o struktuře těchto systémů a zaslouží proto hlubší analýzu z hlediska energetiky pozorovaných intermolekulárních interakcí. V rámci tohoto projektu budou vyřešeny další struktury HIV-1 proteázy s inhibitory, které budou použity pro objasnění role slabých vodíkových vazeb pozorovaných v těchto systémech. Interakční energie mezi proteázou a inhibitory bude detailně analyzována pomocí molekulárního modelování. Práci bude předcházet důkladný rozbor přesnosti užitých metod, zejména popisu slabých vodíkových vazeb pomocí molekulárního modelování.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - another secondary branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Using X-ray diffraction analysis, several structures of HIV-1 protease in complexes with its inhibitors were solved. Using molecular modelling, importance of conformational changes and binding energies was assessed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-KJ-U/07:5
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
1,218 thou. CZK
Public financial support
945 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK