The application of detection and analytical techniques in surveillance of food borne parasites
Project goals
Foodborne parasites (FBP) are numerous and include protozoa, nematodes (roundworms), cestodes (tapeworms), and trematodes (flukes). They have very differing lifecycles and transmission routes. Some FBP are transmitted by ingestion of developmental stages in meat; others with food contaminated by stages excreted in faeces. The availability of good diagnostic methods and algorithms differ between countries and regions in Europe and other parts of the world. Many FBP are zoonotic, such that animals are either essential in maintaining the lifecycle or can act as reservoirs of infection. It is therefore important to have a One Health approach and to have competence and understanding shared between public health and veterinary health, along with all other parts of the food-chain. The proposed project will be aimed at the following: 1) To optimize molecular diagnostic tools for some FBP with regard to different aspects: human diagnostics, veterinary diagnostics and food analysis (varies according to parasite and matrix). 2) To develop and optimize of the routine screening tool for the detection and semi-quantification of multiple FBP using MagPix technology. Particularly, the main focus will be directed on the employment of MOL-PCR for the simultaneous detection and quantification of the most significant FBP in complex food, environmental and clinical samples. 3) To apply molecular methods (e.g. qPCR, MOL-PCR, RFLP, sequencing) for the study of FBP in the frame of ecological epizootological studies. 4) To study experimental surveillance of FBP in the water environment with the focus for prevention (contamination or infection in the animals), removal or elimination; and inactivation.
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 5 (SMSM2015LD5)
Main participants
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-33315/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Použití detekčních a analytických metod molekulární biologie při studiu výskytu a přežívání parazitů kontaminujících potraviny
Annotation in Czech
Hlavním cílem tohoto projektu je vývoj a optimalizace nástrojů molekulární detekce FBP pomocí MagPix technologie využívající MOL-PCR, která je vhodná pro současnou detekci a kvantifikaci nejvýznamnějších FBP v jednom vzorku pocházejícím z klinického materiálu, prostředí nebo potraviny. Použití rychlých a vysokokapacitních standardizovaných metod pro detekci alimentárních parazitů je základním předpokladem pro kontrolu a produkci zdravotně nezávadných potravin. Standardní qPCR, MOL-PCR a genotypizační techniky budou dále použity pro sledování výskytu T. gondii u hospodářských zvířat (prasata, kozy, slepice) i volně žijící zvěře (prase divoké, jeleni, bažanti atd.) jako možných zdrojů infekce. Výskyt G. intestinalis a C. parvum bude sledován u potravin rostlinného původu určených ke přímé spotřebě (např. listová zelenina, bylinky, jahody) a případně v možných cestách jejich sekundární kontaminace (např. zavlažovací nebo oplachová voda). Tato data přinesou ucelenou představu o situaci v ČR, která dosud nebyla podrobně prostudována. Případné studium životaschopnosti a přežívání alimentárních parazitů (např. C. parvum nebo G. intestinalis) pomůže rozšířit znalosti použitelné v oblasti prevence (míra kontaminace), odstranění nebo inaktivace kauzálního agens.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
GM - Food industry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
21101 - Food and beverages
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
A promising new technology has been introduced to allow multiplex detection of several parasitic agents in the analyzed sample, which will allow future diagnostic panels to be expanded. The study of the prevalence of selected food parasites has brought new knowledge of food safety at the producer level. We particularly appreciate the data of expanding knowledge on the contamination of foodstuffs of plant origin intended for direct consumption, which are still insufficient. The results are published in the form of 2 reviewed and 3 impacted publications, as well as 5 papers at conferences
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 24, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2018
Finance
Total approved costs
1,582 thou. CZK
Public financial support
1,582 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 582 CZK thou.
Public support
1 582 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
EE - Microbiology, virology
Solution period
01. 10. 2015 - 31. 12. 2017