Evolution of terpenoid biosynthesis in insects
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2024LU004
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
-
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce biosyntézy terpenoidů u hmyzu
Annotation in Czech
Obecným cílem projektu je mechanistické pochopení konvergenčních evolučních procesů, které vedly k opakovanému vzniku schopnosti biosyntézy terpenických sekundárních metabolitů (TSM) u hmyzu.Zastřešující hypotézou, založenou na několika pionýrských pozorováních z posledního desetiletí, je, že příslušné biosyntetické enzymy TPS opakovaně vznikaly z kanonických isoprenyldifosfátsyntáz (IDS) přítomných v primárním metabolismu. Prostředkem k dosažení tohoto cíle je pak řada cílů dílčích, sdružených do čtyř navazujících etap. ETAPA I. Nalezení kandidátních sekvencí potenciálních TPS enzymů u cílových taxonů, tedy hledání paralogních sekvencí IDS enzymů v dostupných databázích, ve vlastních sekvenačních datech a také s pomocí predikčních nástrojů využívajících strojové učení z dříve publikovaných či námi nově charakterizovaných TPS. ETAPA II.Funkční charakterizace kandidátních TPS s pomocí exprese v heterologních systémech, nalezení preferovaných substrátů a produktů za různých reakčních podmínek. ETAPA III.Charakterizace proteinových struktur objevených TPS studovaných druhů spolu se strukturou ancestrálních IDS, z nichž vznikly, vyřešení případného multimerního uspořádání, popsání strukturních determinant IDS funkce, TPS funkce, případně bifunkčnosti objevených TPS. ETAPA IV.Syntéza poznatků z předchozích etap v evolučním kontextu, hledání obecností a idiosynkrazií při konvergentním vzniku TPS mezi hmyzími liniemi i ve srovnání s rodinou rostlinných TPS.Cílovou skupinou projektu jsou vybrané druhy termitů (Blattodea: Isoptera), švábů (Blattodea), strašilek (Phasmatodea), mravenců (Hymenoptera: Formicidae) a jeden druh mouchy vrtule (Diptera: Tephritidae). Výběr cílových taxonů zohledňuje chemickou identitu produkovaných TSM, zároveň z většiny cíleně zahrnuje druhy škodlivé a/nebo invazní. Popis produkce obranných nebo komunikačních látek, tedy důležitého aspektu jejich biologie, jež jim umožňují přežití, bude patřičným příspěvkem k poznání těchto významných druhů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Sep 1, 2024
Realization period - end
Sep 30, 2027
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 24, 2025
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-LU-R
Data delivery date
Mar 7, 2025
Finance
Total approved costs
8,103 thou. CZK
Public financial support
6,781 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
1,322 thou. CZK