Design and establishment of guidelines for metabolomics of polar compounds in gut microbiota studies
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2025LU002
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
-
Alternative language
Project name in Czech
Návrh a zavedení postupů pro metabolomické stanovení polárních sloučenin ve vzorcích střevní mikrobioty
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je definovat široce použitelný, robustní a reprodukovatelný metodický základ pro metabolomickou analýzu střevních vzorků se specifickým zaměřením na identifikaci krátkých peptidů a aplikovat tuto metodiku v modelových experimentech s cílem charakterizovat biologickou funkci vybraných di- a tri-peptidů ve střevním metabolomu. Toho bude dosaženo řešením dílčích cílů, které zároveň reflektují rozdělení projektu do čtyř etap (viz také Ganttův diagram v nepovinné příloze): 1) Vývoj a validace LC-MS/MS metody pro cílenou metabolomiku di- a tri-peptidů v biologických vzorcích včetně kvantifikace vybraných látek. 2) Ověření metody na myším modelu a identifikace peptidů asociovaných s konkrétním mikrobiomem. 3) Aplikace metody na vzorky pocházející z dalších typů matric (umělé střevo, lidská stolice, sérum). 4) Studium biologické relevance identifikovaných krátkých peptidů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
10607 - Virology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation<br>EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Sep 1, 2025
Realization period - end
Sep 30, 2028
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-LU-R
Data delivery date
Sep 18, 2025
Finance
Total approved costs
6,843 thou. CZK
Public financial support
6,843 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK