Amino acid modification and their influence on biocatalyst stability.
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT
Call for proposals
KONTAKT 6 (SMSM2008ME3)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
7326/2010-32
Alternative language
Project name in Czech
Modifikace aminokyselin a jejich vliv ma stabilitu enzymových biokatalyzátorů.
Annotation in Czech
Předmětem tohoto návrhu je výzkum aminokyselinových modifikací u enzymu pyranose 2-oxidázy (P2Ox) generovaných během přeměny substrátu a studie vlivu těchto modifikací na stabilitu enzymu. Metody hmotnostní spektrometrie budou použity k identifikaci modifikovaných aminokyselin vyvolaných buď reakcí enzymu s vedlejším produktem (H2O2) nebo s produktem přeměny (ketocukr). Hlavním cílem projektu je studium molekulárních aspektů stability P2Ox, a to zejména: (i) identifikace oxidace Met aminokyselinových zbytků jak v blízkostí aktivního centra, tak i zbytků lokalizovaných na povrchu enzymu a dále (ii) identifikace možné tvorby Schiffových bazí povrchových lysinových zbytků s ketocukry. Modifikované aminokyseliny budou nahrazeny bodovými mutacemi s cílem stanovit vliv těchto aminokyselin na stabilitu enzymu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We found Phe454 as being oxidized during sugar conversion using pyranose 2-oxidase, which led to an inactivation of the enzyme. Based on the results we suggest that Phe454 plays a crucial role in the active loop site during the substrate binding.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-MSM-ME-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2011
Finance
Total approved costs
122 thou. CZK
Public financial support
122 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK