MitoChip: microarray for mitochindrial gene expression analysis and its application for study of nuclear defects of oxidative phosphorylation
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Branch programm of research of the Ministry of Health
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví 1 (SMZ02004NR)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Mitočip: příprava DNA čipu pro analýzu exprese mitochondriálních genů a jeho aplikace ve studiu molekulární podstaty nukleárně kodovaných poruch respiračního řetězce
Annotation in Czech
Poruchy respiračního řetězce představují skupinu závažných dědičně podmíněných onemocnění, která se vyskytují v populaci s frekvencí cca 1:8000. Přibližně polovina všech defektů je podmíněna mutacemi nukleárně kódovaných mitochondriálních genů. Identifikace podmiňujících genů metodami pozičního klonování, funkční komplementace a sekvenování je limitována velikostí diagnostikovaných rodin, možností definice fenotypu, možností sledování biochemického fenotypu in-vitro a počtem kandidátních genů. Cílem projektu je příprava DNA čipu pro sledování exprese mitochondriálních genů, analýza a porovnání genové exprese v kontrolních tkáních a tkáňových kulturách a ve vzorcích od pacientů s nukleárně kodovanými poruchami respiračního řetězce. Analýza profilů genové exprese a porovnání normálních "standardních" expresních profilů s profily studovaných patologických stavů může významně přispět k určení molekulární podstaty a mechanismu nukleárně kódovaných defektů respiračního řetězce.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FG - Paediatrics
CEP - another secondary branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)<br>30209 - Paediatrics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We developed oligonucleotide microarray allowing gene expression analysis of 1632 human mitochondria-related genes and analyzed patients with mitochondrial ATPase deficiency. The analysis defined candidate disease causing genes.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-MZ0-NR-U/06:2
Data delivery date
Aug 8, 2007
Finance
Total approved costs
6,198 thou. CZK
Public financial support
6,060 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK