Molecular typing of syphilis-causing strains in the Czech Republic and detection of mutations leading to macrolide resistance
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Ministry of Health?s Departmental Research and Development Programme III
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 1 (SMZ0201001)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NT11159-5/2010
Alternative language
Project name in Czech
Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů
Annotation in Czech
Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat kmenově specifické genomové sekvence a takégeneticky vyšetřovat citlivost na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu. Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci původce syfilis.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
From a practical point of view,a very important finding is the high resistance of T.pallidum strains to macrolide (67%),which means that these antibiotics can no longer be considerered as drugs of chise for syphilis treatment.
Solution timeline
Realization period - beginning
Sep 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 21, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-MZ0-NT-U/05:3
Data delivery date
Dec 14, 2015
Finance
Total approved costs
7,231 thou. CZK
Public financial support
7,231 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK