Mechanisms of the effect of genetic variants of LDL receptor and the role of genetic variants of lipoprotein(a) in the development of hypercholesterolemia in FH patients
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202000001
Main participants
Fakultní nemocnice Brno
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU20-02-00261
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismy účinku genetických variant LDL receptoru a role genetických variant lipoproteinu(a) při vzniku hypercholesterolémie u pacientu s FH
Annotation in Czech
Frekvence familiární hypercholesterolémie (FH) je u většiny populací asi 1/200 a je tedy možné předpokládat, že v ČR by mohlo být postiženo přibližně 50 000 osob. Řešení projektu lze rozdělit do dvou pracovních bloků (PB). PB1 je zaměřen na funkční analýzu variant genu LDLR in vitro a využívá metod průtokové cytometrie, konfokální mikroskopie na živých buňkách, qRT-PCR a sestřihových minigenových testů. Varianty LDLR budou hodnoceny na úrovni exprese, zrání, lokalizace a funkce daného proteinu a na úrovni buněčné odpovědi (aktivace tzv. unfolded protein response). PB2 je zaměřen na analýzu DNA pacientů. Metodou NGS bude provedena re-analýza pacientů s FH s dosud negativní genetickou diagnózou a budou aplikovány metody pro stanovení počtu repetic Kringle IV v genu LPA (PFGE a Southernova hybridizace) pro rozřazení pacientů do skupiny s nižšími nebo vyšší riziky předčasné aterosklerózy. Všechny uvedené přístupy mají společný cíl – identifikovat genetické varianty způsobující FH a získat nové informace o patogenitě FH.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
1.The project is of a very high quality and contributed to the improvement of the genetic diagnosis of homozygous and heterozygous forms of familial hypercholesterolemia. 2. The data/results are well described and balanced from the methodological point of view and result and include also methodological difficulties encountered during the study. 3. The project could be beneficial for the prevention of cardiovascular diseases of atherosclerotic origin including mainly ischemic heart disease. 4. The publications based on the results of the project are of high quality and published in professional journals of high prestige including those not focused only on genetic fields (Lancet). 5. There were not detected any problematic approaches regarding compliance with the established rules, namely tender documents or compliance in the use of financial support.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-U
Data delivery date
Jul 3, 2024
Finance
Total approved costs
12,741 thou. CZK
Public financial support
12,741 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK