All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Whole exome, low-coverage genome and transcriptome sequencing as tools for precision oncology in paediatric patients with high-risk and relapsed solid tumors

Public support

  • Provider

    Ministry of Health

  • Programme

  • Call for proposals

    SMZ0202000001

  • Main participants

    Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    NU20-03-00240

Alternative language

  • Project name in Czech

    Celoexomové sekvenování, sekvenování genomu s nízkým pokrytím a transkriptomu pro účely precizní onkologie u dětských pacientů s vysoce rizikovými a relabovanými solidními nádory

  • Annotation in Czech

    Děti s vysoce rizikovými a relabujícími solidními nádory představují skupinu 15-20% onkologicky nemocných dětí, u kterých nedokážeme nepříznivý průběh jejich nemoci zvrátit. Pro tyto pacienty je nutné hledat nové možnosti a strategie léčby. Nezbytnou podmínkou pro efektivní terapii je nejen podrobná histopatologická charakterizace nádoru, ale také adekvátní molekulárně biologické vyšetření. V nádoru se může vyskytovat několik druhů aberací, které přispívají k rozvoji nádorového onemocnění. Jedná se např. o záměny menšího rozsahu, amplifikace onkogenů či delece tumor supresorových genů, či zvýšeně exprimované geny. Všechny tyto události lze identifikovat moderními metodami založenými na sekvenování nové generace. Některé z takto detekovaných změn představují potenciální terapeutický cíl, jiné jsou důležitými prognostickými faktory. Obecným cílem projektu je využití celoexomového sekvenování, sekvenování genomu s nízkým pokrytím a transkriptomu jako významných diagnostických nástrojů pro tvorbu individualizovaných léčebných plánů pro děti s vysoce rizikovými solidními nádory.

Scientific branches

  • R&D category

    AP - Applied research

  • OECD FORD - main branch

    30204 - Oncology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    FD - Oncology and haematology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    The project yields excellent results that fulfill the set objectives and demonstrate the significant contribution of combining whole-exome/ -genome sequencing along with transcriptome analysis for identifying molecular targets and individualizing treatment in high-risk pediatric patients with solid tumors. It showed that this approach enables finding therapeutically actionable alterations in 39% of patients, thus providing guidance for selecting targeted therapy in a population with unsatisfactory treatment outcomes. The quality of the achieved results are evidenced by publications in prestigious international journals (7 papers with IF 3.8-41, 2 more accepted/submitted) and presentations at conferences. Thanks to its multidisciplinarity, the project interconnects basic research with applications in clinical medicine and contributes to advancing precision oncology. The project was carried out according to the plan, without deficiencies in utilizing the allocated financial resources.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    May 1, 2020

  • Realization period - end

    Dec 31, 2023

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 28, 2023

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP24-MZ0-NU-U

  • Data delivery date

    Jul 3, 2024

Finance

  • Total approved costs

    17,455 thou. CZK

  • Public financial support

    17,455 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK