Global methylation profiles and comprehensive analysis of gene fusions as a basis for therapeutic planning in pediatric oncology
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV19-03-00562
Alternative language
Project name in Czech
Využití globálních metylačních profilů a komplexní analýzy fúzních genů pro terapeutické plánování v dětské onkologii
Annotation in Czech
Dětská onkologie dosáhla v posledních třiceti letech dramatických výsledků s poklesem mortality onkologicky nemocných dětí o více než 50%. Stále však existuje 15-20% dětí, u kterých se nepříznivý průběh jejich nemoci nedaří zvrátit. Pro tyto pacienty je nutné hledat nové, individualizované strategie léčby. Nezbytnou podmínkou pro tento koncept tzv. precizní medicíny je detailní molekulárněbiologická charakterizace tumoru. Kromě změn v kódujících oblastech DNA (nádorovém exomu) existují další molekulární změny přispívající k rozvoji nádorového onemocnění. Mezi ně patří epigenetické procesy, jako je metylace DNA, či genové strukturální přestavby, které vedou ke vzniku fúzních genů. Řada těchto metylačních změn a fúzních genů silně ovlivňuje chování nádoru a je možné je cílit dostupnými léčivy nebo jsou důležitými prognostickými faktory. Obecným cílem projektu je ověřit, zda analýza globálních metylačních profilů a fúzních genů představuje přínos pro terapeutické plánování u dětských pacientů s vysoce rizikovými solidními nádory, u nichž je známá sekvence nádorového exomu.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project yielded significant findings on the use of methylation profiling and fusion gene detection in the diagnosis and treatment of high-risk pediatric solid tumors. The results support the implementation of these methods in clinical practice to refine diagnosis, improve patient stratification, and utilize targeted therapy. The project generated 8 high-quality publications in international journals dedicated to the project. The project met and exceeded the planned objectives without any shortcomings in the use of funds or compliance with the project assignment.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jul 3, 2024
Finance
Total approved costs
15,965 thou. CZK
Public financial support
15,904 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
61 thou. CZK