Feasibility study of next generation sequencing for individualized therapy of patients with solid tumors

Project name in Czech
Studie využitelnosti sekvenování nové generace pro individualizovanou léčbu pacientů se solidními nádory
Annotation in Czech
Analýza molekulárních biomarkerů umožňujících predikci reakce nádorů na léčbu a zavedení optimální metody pro jejich sledování představují zásadní výzvy současného translačního výzkumu. Tento projekt má za cíl prozkoumat využitelnost metody sekvenování příští generace pro hledání genetických biomarkerů, specifických pro českou populaci, které by umožnily rozdělení pacientů se solidními nádory do prognosticky významných skupin. V rámci projektu bude studován genetický profil pacientů se solidními nádory léčenými adjuvantní terapií režimy založenými na nukleosidových analozích, taxanech a platinových derivátech. Metoda celoexomového sekvenování bude poprvé použita ke studiu tohoto fenoménu u českých pacientů s malignitami. Výsledky studie budou porovnány s daty ve veřejně dostupných databázích, např. TCGA, ICGC a s výstupy projektu NCLG, který mapuje genetickou variabilitu obecné české populace. Hlavním výstupem projektu bude validovaný panel zárodečných variant a somaticky významných genů pro další studie a analýza účinnosti panelového sekvenování, ve srovnání s celoexomovým přístupem.

R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FS - Medical facilities, apparatus and equipment

Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has successfully investigated genetic variants in patients with malignant disease using whole-exome sequencing. The main aim was to create a Czech database of genetic variants in patients with colorectal cancer, pancreatic adenocarcinoma and epithelial ovarian cancer. This goal was successfully pursued throughout the project. The knowledge gained in the project significantly advances the understanding of the relationship between a patient's genetic status and their cancer prognosis. The new findings also address potential improvements in personalised therapy. The new knowledge gained has been published in renowned journals. From the perspective of oncology and health care, the fact that these cancers are very serious cancers with a significant incidence and mortality should be considered very positively. The project has been managed without formal shortcomings.

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jul 3, 2024

Similar projects(10)