Advanced molecular testing for aggregate diagnosis and management of DLBCL patients: engagement of gene expression profiling, liquid biopsy and long-read sequencing
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202200001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU22-08-00227
Alternative language
Project name in Czech
Pokročilé molekulární analýzy pro komplexní diagnostiku a monitorování pacientů s difúzním velkobuněčným B-lymfomem: využití profilování genové exprese, tekutých biopsií a sekvenování třetí generace
Annotation in Czech
Difúzní velkobuněčný B-lymfom (DLBCL) je nejčastějším typem non-Hodgkinských lymfomů u dospělých, pro který je charakteristická výrazná heterogenita klinicko-patologických i genetických vlastností. Navzdory značnému pokroku v molekulární klasifikaci i terapii tohoto typu lymfomu, 30-40 % pacientů přesto prodělá relaps onemocnění nebo je na léčbu refrakterní. V současné době je v popředí klinicky orientovaného výzkumu DLBCL zejména vývoj rutinních molekulárních vyšetření a také možnosti cílené personalizované terapie. V navrhovaném projektu si klademe za cíl přispět k lepší biologické charakterizaci a prognostické stratifikaci pacientů za pomoci moderních metod použitelných v rutinní klinické praxi. Plánujeme zavést metodu na profilování genové exprese a statistického nástroje pro rozlišení ABC a GCB podtypů, analyzovat pacient-specifické markery pomocí NGS ve volné DNA z tekutých biopsií (plazma a likvor) pro monitorování choroby a včasný záchyt pacientů s vysokým rizikem relapsu nebo infiltrace centrální nervové soustavy a v neposlední řadě identifikovat tzv. double a triple-hit lymfomy pomocí sekvenování dlouhých readů (Nanopore technologie). Tyto metody mohou být využitelné v běžné praxi jako alternativní nebo doplňkové technologie ke standardním vyšetřením u DLBCL pacientů. Předpokládáme, že vhodné nástroje pro identifikaci pacientů se špatnou prognózou pomůžou lékařům zlepšit péči o tyto pacienty a přinést tak prospěch pro jejich přežití. Náš projekt může tedy přispět k praktickému využití precizní medicíny u DLBCL.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EI - Biotechnology and bionics
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
12,776 thou. CZK
Public financial support
12,776 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK