Molecular epidemiology of invasive meningococcal disease in the Czech Republic.
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Main participants
Státní zdravotní ústav se sídlem v Praze
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-34887A
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární epidemiologie invazivního meningokokového onemocnění v České republice.
Annotation in Czech
Cílem projektu je vyvinutí molekulární surveillance invazivního meningokokového onemocnění v České republice, který umožní odlišení případů selhání vakcinace od nepokrytí vakcínou a aktualizaci doporučení vakcinační strategie v souladu se zjištěnými výsledky. K dosažení cíle povedou tyto kroky: sběr izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění, molekulární charakterizace všech izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění klasickými sekvenačními typizačními metodami a sekvencí genů antigenů, implementace nových sekvenačních metod, tj. sekvenace celého genomu, implementace nové PCR metody, tj. RT-PCR pro bezkultivační molekulární charakterizaci kultivačně negativních případů invazivního meningokokového onemocnění, charakterizace vybraných izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění metodou sekvenace celého genomu, analýza molekulárních charakteristik izolátů N. meningitidis, aktualizace doporučení vakcinační strategie podle zjištěných výsledků.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
CEP classification - main branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was completed in accordance with the plan and timetable. All aims set were met during the completion of the project. New molecular methods were introduced: whole genome sequencing (WGS) of Neisseria meningitidis and nonculture rt-PCR detection and typing of N. meningitidis from clinical specimens directly. These new molecular methods were implemented in the invasive meningococcal disease surveillance program in the Czech Republic and provide more accurate surveillance data, including those on meningococcal vaccine coverage of Czech isolates of N. meningitidis. Based on molecular surveillance of invasive meningococcal disease, a proposal for updating the recommendation for immunisation against invasive meningococcal disease was submitted to the Czech Vaccination Society of the Jan Evangelista Purkyně Czech Medical Association. Molecular characteristics of N. meningitidis obtained during the completion of the project were reported to the international databases continuously.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 28, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MZ0-NV-U/01:1
Data delivery date
Jun 28, 2019
Finance
Total approved costs
6,650 thou. CZK
Public financial support
6,329 thou. CZK
Other public sources
419 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK