Study of meningococcal population by the whole genome sequencing method - base for update of vaccination strategy
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Main participants
Státní zdravotní ústav se sídlem v Praze
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV19-09-00319
Alternative language
Project name in Czech
Studium populace meningokoků metodou sekvenace celého genomu - podklady pro aktualizaci vakcinační strategie
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na studium populací meningokoků metodou sekvenace celého genomu (WGS). Tato nová sekvenační metoda dává možnost nejen přesnějšího odlišení izolátů Neisseria meningitidis ve srovnání s předchozími klasickými sekvenačními metodami, ale umožňuje i studium faktorů virulence tohoto agens. Pro studium metodou WGS budou vybrány izoláty od zdravých nosičů, párové izoláty od pacientů s invazivním meningokokovým onemocněním a jejich zdravých kontaktů a párové izoláty z různého klinického materiálu od pacientů s invazivním meningokokovým onemocněním. Data WGS získaná řešením projektu budou analyzována nejen z hlediska klonality populací N. meningitidis, ale i z hlediska přítomnosti genů virulence a možnosti pokrytí vakcínami proti N. meningitidis B. Výsledky řešení projektu prohloubí znalosti o faktorech virulence meningokoků, o úloze nosičství N. meningitidis v šíření invazivního meningokokového onemocnění, o možnosti redukování nosičství N. meningitidis novými vakcínami proti meningokoku B a budou podkladem doporučení pro aktualizaci vakcinační strategie v České republice.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30303 - Infectious Diseases
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
30302 - Epidemiology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology<br>FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This is a very high quality project that has fulfilled its stated objectives and provided significant results applicable in routine clinical practice and internationally.In terms of the number of results, the author of the project fulfilled the planned impacted publications, 3xJimp.The declared number of Jsc 2x publications was not met. All published results are related to the project objectives applicable in practice. The management of funds was efficient.I consider the project to be beneficial in terms of obtaining knowledge of molecular characteristics of Czech isolates of N.meningitidis, the causative agent of life-threatening disease,which can be better prevented with a correctly chosen vaccination strategy if the circulating agents are known.The benefit is the comparison of the characteristics of the originators obtained in the past and the possibility of comparison with other countries in the framework of the continuous reporting of sharing results to international databases.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
7,826 thou. CZK
Public financial support
7,230 thou. CZK
Other public sources
596 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK