Molecular basis and mechanisms of familial intrahepatic cholestasis
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 4 (SMZ0201800001)
Main participants
Institut klinické a experimentální medicíny
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV18-06-00032
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární příčiny a mechanismy dědičných intrahepatálních cholestáz
Annotation in Czech
V letech 2002-2017 jsme analyzovali genomovou DNA od 123 nepříbuzných probandů se suspektní progresivní či rekurentní intrahepatální cholestázou (PFIC nebo BRIC). Mutační analýza ATP8B1, ABCB11, a TJP2 byla provedena u 82 nemocných s normální aktivitou GGT. ABCB4 byl sekvenován u 41 nemocných se zvýšenou aktivitou GGT. U 38 (30,8%) probandů se podařilo potvrdit dg PFIC1 (n=1), PFIC2 (n=14), BRIC (n=10), PFIC3 (n=5) a mírných forem deficitu MDR3 (n=8). U 85 (69,2%) nemocných je dg nejasná. Naším cílem je zjistit molekulární příčinu a mechanizmus choroby u většiny či alespoň u některých z těchto 85 pacientů. K jeho dosažení plánujeme provést sekvenování exomu a v odůvodněných případech i sekvenování genomu, analýzu počtu kopií či RNAseq u většiny z těchto 85 pacientů a jejich rodinných příslušníků. Exprese mutovaných proteinů bude studována imunohistologicky. Patogenita nových mutací bude testována na úrovni mRNA a proteinu na transfekovaných buněčných liniích. Očekávané výsledky viz Specifické cíle v sekci Cíle projektu.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30218 - General and internal medicine
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FE - Other fields of internal medicine
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The research project focused on genetically linked intrahepatal cholestasis. The aim was to evaluate possible responsible molecular mechanisms using the sequential exome analysis. Totally, 127 biologic samples were analysed (exome sequential analyisi, in 15 also additive Sanger sequential analysis). On authors request, the time for their research was prolonged, due to technically determined problems, which, however, were solved. Detailed results of research are provided in published original scientific articles and also in autor´s final report. The aim to achieve two JIMP articles has been achieved.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
8,630 thou. CZK
Public financial support
8,526 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
104 thou. CZK