New approaches to non-invasive diagnostics of mitochondrial diseases
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Programme to support medical applied research in 2015 to 2022
Call for proposals
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NV19-07-00149
Alternative language
Project name in Czech
Nové přístupy k neinvazivní diagnostice mitochondriálních onemocnění
Annotation in Czech
Mitochondriální onemocnění jsou vyvolané nedostatečnou funkcí energetického aparátu a patří k závažným dědičným poruchám metabolismu. Řada kauzálních mutací již byla identifikována díky rozvoji exomového sekvenování, ale stále se nedaří nalézt genetickou příčinu u téměř 40% případů. Kvalitní neinvazivní biochemická charakterizace pacientů s podezdřením na mitochondriální onemocnění zásadní pro úspěšnou interpretaci exomových dat. Cílem projektu je využití krevních elementů jako materiálu pro standardizovanou a reprodukovatelnou biochemickou charakterizaci pacientů. Bude optimalizována metodika kryoprezervace krevních elementů kompatibilní s následnou analýzou mitochondriálních funkcí. Ty budou poté analyzovány pomocí vysoce citlivé respirometrie u permeabilizovaných buněk a analýzou preferovaných metabolických drah u buněk intaktních. U pacientů s biochemicky potvrzeným nálezem bude provedeno exomové sekvenování pro určení genetické příčiny a nově nalezené varianty budou dále funkčně validovány.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
30209 - Paediatrics
OECD FORD - secondary branch
30101 - Human genetics
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>FG - Paediatrics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
As part of the project, it was possible to introduce a methodology for isolation, cryopreservation and respirometric evaluation of mitochondrial function in PBMC cells (peripheral mononuclear cells) obtained from patients with a confirmed or suspected defect in mitochondrial metabolism. Specific parameters obtained during respirometric analysis were defined that can serve as predictive markers for complex I defects (low portion of cI dependent coupled respiration), mutations in SURF1 (UCR values above 1) and ATP synthase defects (UCR values above 1.2). During the duration of the project, a total of 31 patients with mitochondrial disease were sequenced by NGS and the genetic cause was revealed in a total of 16 cases. Furthermore, we analyzed in detail the pathophysiological mechanisms associated with mutations in UQCRC2, POLRMT, AIFM1 and MECR genes, encoding mitochondrial proteins. The work produced high-quality publication outputs and contributed to the clarification of the genetic ca
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MZ0-NV-U
Data delivery date
Jun 22, 2023
Finance
Total approved costs
14,521 thou. CZK
Public financial support
14,521 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK