Genetic bases of combined deficiency of oxidative phosphorylation complexes
Project goals
Mitochondrial diseases caused by deficiency of one or several OXPHOS complexes represent a heterogeneous group of severe metabolic disorders caused by mutation in mtDNA or >100 nuclear genes. In group of 57 patients with combined OXPHOS deficiency of unknown etiology, the genetic bases of the disease will be studied. Mitochondrial proteosythesis will be analysed in fibroblasts, mtDNA amount will be determined in available tissues, and candidate genes will be sequenced in patients with mtDNA depletion or defective mitochondrial proteosythesis. In patients´ DNA, copy-number variations in genome will be analysed and whole exome will be sequenced. Identified mutations will be verified by complementation experiments in fibroblasts and etiopatogenesis of the disease will be studied. Data will be correlated with clinical and laboratory phenotype of patients. Results will be implemented into diagnostics and they significantly improve care about patients and genetic counseling in affected families.
Keywords
mitochondrial disordersoxidative phosphorylationcombined OXPHOS deficiencygenetic cause of disease
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
Ministry of Health?s Departmental Research and Development Programme III
Call for proposals
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 3 (SMZ0201201)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NT13114-4/2012
Alternative language
Project name in Czech
Genetická podstata kombinovaných poruch komplexů oxidativní fosforylace
Annotation in Czech
Mitochondriální onemocnění, způsobená poruchou jednoho či více komplexů oxidativní fosforylace (OXPHOS), tvoří klinicky heterogenní skupinu závažných metabolických chorob, způsobenými mutacemi jak v mitochondriální DNA, tak i ve >100 jaderných genů. V souboru 57 pacientů s kombinovanou poruchou komplexů OXPHOS neznámé etiologie bude studována genetická příčina onemocnění. Bude studována mitochondriální proteosyntéza ve fibroblastech, stanoveno množství mtDNA v dostupných tkání, a sekvenovány kandidátní geny u pacientů s poruchou mitochondriální proteosyntézy nebo deplecí mtDNA. Budou analyzovány delece v genomu a sekvenován exom pacientů. Zjištěné genetické determinanty onemocnění budou ověřeny komplementačními studiemi ve fibroblastech a bude studována etiopatogeneze onemocnění. Data budou korelována s klinickými a laboratorními nálezy u pacientů. Nové znalosti budou aplikovány v diagnostice, zlepší se genetické poradenství včetně prenatální diagnostiky v rodinách a zkvalitní se péče o pacienty.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
FG - Paediatrics
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30209 - Paediatrics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Research group completed studies of mitochondrial proteosynthesis in fibroblasts of pediatric and adult subjects with combined OXPHOS complex disorder and analysis of candidate genes incl. mitochondrial DNA quantification - in 69 probands and 47 parents.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 20, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MZ0-NT-U/02:1
Data delivery date
Dec 19, 2016
Finance
Total approved costs
9,698 thou. CZK
Public financial support
9,650 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
48 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 698 CZK thou.
Public support
9 650 CZK thou.
99%
Provider
Ministry of Health
CEP
FG - Paediatrics
Solution period
01. 04. 2012 - 31. 12. 2015