Novel diagnostic approaches for rapid detection and epidemiological analysis of serious bacterial and viral infections
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202400001
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NW24-09-00464
Alternative language
Project name in Czech
Nové diagnostické přístupy pro rychlou detekci a epidemiologickou analýzu závažných bakteriálních a virových infekcí
Annotation in Czech
Antibiotika jsou i skoro po sto letech od jejich objevení stále nejlepší zbraní pro boj s bakteriální infekcí. Bohužel, jejich nesprávné používání, ať záměrné nebo z neznalosti, vede ke vzniku jevu, který se označuje jako antibiotická resistence. Jen v Evropě každoročně zemře 33 000 lidí v důsledku infekce způsobené bakterií odolné na antibiotika. Některé studie dokonce odhadují, že pokud bude tento trend pokračovat stejným tempem, bude mít v roce 2050 na svědomí 10 milionů úmrtí ročně, což by bylo více než rakovina. Přestože se diagnostika v mikrobiologii neustále zlepšuje a zejména zavedením MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie do mikrobiologické praxe v oblasti taxonomické identifikace bakterií došlo k rozšíření této metody na další aplikace, především v oblasti detekce antibiotické rezistence a epidemiologické typizace, jsou zde značné rezervy. Současné hmotnostně-spektrometrické přístupy naráží na limity, které spočívají v omezeném množství proteinů, které jsou identifikovány z celých mikrobiálních buněk. Dominantní jsou především abundantní proteiny, např. proteiny ribozomální. Tento limit je v současnosti řešen různými přístupy k analýze dat, např. strojovým učením. Přesto však lze konstatovat, že řadu významných epidemiologických markerů nelze v současnosti identifikovat kvůli jejich nízkému zastoupení v analyzovaném vzorku. Proto je pro další rozvoj diagnostických metod v oblasti klinické mikrobiologie žádoucí hledat nové přístupy zpracování a analýzy vzorků. Jednou z možností je i využití metod hmotnostní-spektrometrie ve spojení s kapalinovou chromatografii (LC/MS), která je dostupná na řadě diagnostických pracovišť.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NW-R
Data delivery date
Mar 25, 2024
Finance
Total approved costs
12,366 thou. CZK
Public financial support
12,366 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK