Selection of RNA isolation method for molecular detection of grapevine viruses

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F02%3A1280" target="_blank" >RIV/00027006:_____/02:1280 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Selection of RNA isolation method for molecular detection of grapevine viruses

Original language description

Grapevines infected with Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) and Grapevine leafroll-associated virus-3 (GLRaV-3) were selected. Total RNA was isolated from grapevine phloem tissue scrapped from dormant canes by three different methods: extraction with urea buffer followed with phenol-chloroform extraction, method using Concert reagent (Invitrogen) followed with chloroform-isopropylalcohol extraction, and procedure using RNeasy Plant Mini Kit (Qiagen). The highest yield of RNA was obtained using ConcertTM reagent. If this RNA was used in RT-PCR, GLRaV-1 and GLRaV-3 were easily detected. From RNA isolated by other two methods these viruses were not detected.

Czech name

Metoda izolace RNA pro detekci virů z pletiv révy vinné

Czech description

Byly vybrány révy infikované virem spojeným se svinutkou révy vinné 1 (GLRaV-1) a virem spojeným se svinutkou révy vinné 3 (GLRaV-3). Z těchto rostlin byly odebrány vzorky dormantního réví, z jehož lýkového pletiva byla izolována celková RNA použitím třírůzných metod: metody používající močovinový pufr a následnou extrakci směsí fenol-chloroform, metody používající reagencii Concert firmy Invitrogen a metody používající kit RNeasy Plant Mini Kit od firmy Qiagen. Nejvyšší výtěžek RNA byl dosažen s použitím reagencie Concert. Při použití takto izolované RNA v RT-PCR byly snadno detekovány oba viry, GLRaV-1 i GLRaV-3, zatímco u RNA izolovaných jinými metodami nebylo možno tyto viry detekovat.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GP522%2F01%2FD131" target="_blank" >GP522/01/D131: Characterization of grapevine leafroll - associated closteroviruses in the territory of the Czech republic.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2002

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Plant Protection Science, Proceedings 6th Conference of EFPP 2002

ISBN

1212-2580

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

4

Pages from-to

267-270

Publisher name

Institute of Agricultural and Food Information

Place of publication

Praha

Event location

Praha

Event date

Sep 8, 2002

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—