Comparison of three techniques for the detection of Grapevine leafroll-associated virus 1.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F05%3A1282" target="_blank" >RIV/00027006:_____/05:1282 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Comparison of three techniques for the detection of Grapevine leafroll-associated virus 1.

Original language description

Thirty seven plants of grapevine from the Research Station of Viticulture, Karlštejn was examined for the presence of leafroll viruses. Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1) was detected in the grapevines plants tested using double-antibody sandwich ELISA (DAS-ELISA), RT-PCR and molecular hybridization with non-radioactive RNA probes. Both molecular methods were based on a detection of the GLRaV-1 heat-shock protein 70 (HSP70) gene and showed a higher sensitivity in the detection of GLRaV-1 compared to DAS-ELISA. RNA probes are considered more suitable for the GLRaV-1 detection, as their application can overcome potential minor sequence variability, which may cause the detection by RT-PCR less reliable, especially when the variability occursin the genome region targeted by RT-PCR primers. Based on additional DAS-ELISA, other viruses were detected, often in a mix infection: Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3), Grapevine virus A (GVA) and Grapevine fleck virus (GFk

Czech name

Porovnání tří technik pro detekci viru svinutky révy 1.

Czech description

Třicet sedm rostlin révy vinné z Výzkumné stanice vinařské Karlštejn bylo testováno na přítomnost virů způsobujících svinutku révy vinné. Virus svinutky révy vinné 1 (GLRaV-1) byl prokázán v rostlinách révy vinné pomocí metod DAS-ELISA, RT-PCR a molekulární hybridizace s neradioaktivními RNA sondami. Obě použité molekulární metody, založené na detekci genu pro HSP70, prokázaly vyšší citlivost při detekci GLRaV-1 než DAS-ELISA. RNA sondy lze doporučit jako vhodnější metodu pro detekci tohoto viru, protože nejsou ovlivněny menšími změnami v sekvenci detekovaného viru, což by například při RT-PCR mohlo způsobit problémy, pokud by se taková změna vyskytla v oblasti primerů. V testovaných rostlinách byl pomocí DAS-ELISA dále prokázán výskyt viru svinutky révy vinné 3 (GLRaV-3), A viru révy vinné (GVA) a viru skvrnitosti révy vinné (GFkV). Tyto viry se často vyskytovaly ve směsné infekci.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GP522%2F01%2FD131" target="_blank" >GP522/01/D131: Characterization of grapevine leafroll - associated closteroviruses in the territory of the Czech republic.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Acta Virologica

ISSN

0001-723X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

49

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

SK - SLOVAKIA

Number of pages

7

Pages from-to

37-43

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—