Partial molecular characterization of a Czech isolate of Grapevine leafroll-associated virus 3

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F04%3A1248" target="_blank" >RIV/00027006:_____/04:1248 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Partial molecular characterization of a Czech isolate of Grapevine leafroll-associated virus 3

Original language description

Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) is an important pathogen of grapevine in the Czech Republic. A Czech isolate was studied at the molecular level in order to extend data on molecular variability of the virus from the central European region. Three conserved regions (genes encoding the RNA-dependent RNA polymerase, the heat shock protein 70 and the 55 kDa protein) were amplified using reverse transcriptase - polymerase chain reaction, sequenced and compared with related available sequences.On the sequenced regions, the Czech isolate revealed more than 99% nucleotide and amino acid identity with the published full-length sequence of a North American GLRaV-3 isolate and a similarly high identity with available partial GLRaV-3 sequences of isolates from different parts of the world.

Czech name

Částečná charakterizace českého izolátu viru svinutky révy 3 na molekulární úrovni

Czech description

Virus spojený se svinutkou révy vinné 3 (Grapevine leafroll-associated virus 3 - GLRaV-3) je v České republice závažným patogenem révy vinné. Český izolát tohoto viru byl studován na molekulární úrovni, abychom získali poznatky o molekulární variabilitětohoto viru v oblasti střední Evropy. Byly vybrány tři konzervativní oblasti - gen pro RNA polymerázu, gen pro heat-shock protein 70 a gen pro 55 kDa protein. Tyto tři oblasti byly amplifikovány pomocí reverzní transkripce a polymerázové řetězové reakce,osekvenovány a porovnány s dostupnými sekvencemi. Ve zkoumaných oblastech se český izolát shodoval více než z 99% s publikovanou celou sekvencí severoamerického izolátu tohoto viru. Podobně vysokou identitu měl český izolát s dostupnými částečnými sekvencemi GLRaV-3 z různých částí světa.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GP522%2F01%2FD131" target="_blank" >GP522/01/D131: Characterization of grapevine leafroll - associated closteroviruses in the territory of the Czech republic.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Phytopathology

ISSN

0931-1785

e-ISSN

—

Volume of the periodical

152

Issue of the periodical within the volume

7

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

5

Pages from-to

427-431

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—