Analysis of the molecular variability of Grapevine leafroll-associated virus 1 reveals the presence of two distinct virus groups and their mixed occurrence in grapevines.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F05%3A%23%23%23%23%23%2310" target="_blank" >RIV/00027006:_____/05:######10 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Analysis of the molecular variability of Grapevine leafroll-associated virus 1 reveals the presence of two distinct virus groups and their mixed occurrence in grapevines.

Original language description

Genetic diversity of eight Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1) isolates recovered from grapevines in three distinct locations in the Czech Republic and Slovakia was characterised by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis andby sequencing of cloned 540 bp fragment of the heat shock protein 70 (HSP70) gene. Comparison and phylogenetic analysis of obtained and previously available sequence data revealed the existence of two groups of GLRaV-l isolates, tentatively named A andE(genetic divergence between A and E group reached 13.9%). An RT-PCR detection method followed by simple restriction analysis was developed, showing the potential to differentiate GLRaV-1 isolates of these groups. Interestingly, a mixed infection of twoGLRaV-1 groups in the same plant was frequently detected together with a high intra-group variability in some isolates.

Czech name

Analýza molekulární variability viru svinutky révy vinné 1 prokázala existenci dvou skupin viru a jejich současnou přítomnost v rostlinách révy vinné.

Czech description

Pomocí restrikčního štěpení a analýzou sekvence 540 bází dlouhého úseku genu pro HSP70 byla zkoumána genetická diverzita osmi izolátů viru svinutky révy vinné 1 (Grapevine leafroll-associated virus 1 - GLRaV-1). Tyto izoláty pocházely ze tří lokalit v České republice a na Slovensku. Srovnání sekvencí a jejich fylogenetická analýza ukázaly na existenci dvou skupin izolátů GLRaV-1, pro něž byl navržen název A a E. Genetická divergence mezi těmito skupinami dosahuje 13,9%. Pro snadné rozlišení těchto dvouskupin byla navržena metoda založená na RT-PCR s následným restrikčním štěpením. Tímto způsobem byla též prokázána směsná infekce izoláty patřícími k rozdílným skupinám ve stejné rostlině révy vinné.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Virus Genes

ISSN

0920-8569

e-ISSN

—

Volume of the periodical

31

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

9

Pages from-to

247-255

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—