Utilization of Chip Electrophoresis for Characterization of Cereal varieties

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F06%3A1296" target="_blank" >RIV/00027006:_____/06:1296 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Utilization of Chip Electrophoresis for Characterization of Cereal varieties

Original language description

For identification of varieties of cereals we used new electrophoretic system. The Experion automated electrophoresis system applies a combination of microfluidic separation technology and sensitive fluorescent sample detection to perform rapid and automated analysis of protein. It automatically performs all steps of gel-based electrophoresis (sample separation, staining, destaining, imaging, band detection, and even some data analysis) to deliver reproducible separation and quantitation results in just30 minutes. In our laboratory we used this system for analysis of protein of wheat (LMW and HMW glutenin subunits) and barley (hordeins). This approach was compared with the classic electrophoresis these proteins in polyacrylamide gel and sodium dodecylsulphate. Results were characterized by considerable reproducibility and especially protein patterns of wheat obtained these techniques were very comparable.

Czech name

Využití čipové elektroforézy k charakterizaci odrůd obilovin

Czech description

V posledních letech byla vyvinuta tzv.chipová elektroforéza, která je miniaturizovanou modifikací kapilární elektroforézy. Chipová elektroforéza, představuje kombinaci mikrofluidní separační techniky a citlivé fluorescenční detekce pro kvantifikaci obsahové látky (DNA, RNA nebo proteinů). Dosud je použitelná pouze pro elektroforetické separace v přítomnosti dodecylsulfátu sodného (SDS). V naší laboratoři ve VÚRV byla úspěšně vyzkoušena pro analýzy frakce nízkomolekulárních (LMW-GS) a vysokomolekulárních(HMW-GS) podjednotek gluteninů pšenice a hordeinů ječmene ? oba postupy klasické elektroforézy(SDS-PAGE) se používají pro identifikaci genotypů (odrůd, linií) i pro markerování některých znaků jakosti, které jsou s těmito proteinovými složkami ve vazbě.Metoda chipové elektroforézy byla porovnána s klasickou metodou elektroforézy (SDS-PAGE). Pomocí obou technik byly získány srovnatelné výsledky. Výsledky čipové elektroforézy se vyznačovaly vysokou reprodukovatelností.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

CE - Biochemistry

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Book of proceedings: XX. Biochemický zjazd

ISBN

80-969532-6-5

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

410-410

Publisher name

Institute of Molecular Physiology and genetics, Slovak Academy of Sciencis

Place of publication

Piešťany, Slovenská republika

Event location

Piešťany, Slovenská republika

Event date

Sep 12, 2006

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—