Reliability of diagnostic techniques for Erwinia amylovora and Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F08%3A00000268" target="_blank" >RIV/00027006:_____/08:00000268 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Reliability of diagnostic techniques for Erwinia amylovora and Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

Original language description

Erwinia amylovora (Ea) causing fire blight and Clavibacter michiganensis subsp. sepedoniciis (Cms) causing ring rot of potato belong to the quarantine organisms. Detection and determination of both pathogens using different methods were compared. Commercial MAb were used for Cms and PAb for Ea. All Ea strains were reliably identified by PCR (Bereswill and own primers) after optimisation of PCR protocol and using BIOLOG System. PTA-ELISA and IIF were less reliable because of cross-reacting bacteria associated with Ea in host plants. AH Cms strains were reliably identified by IIF and PCR (Mills and Pastrik primers) regardless of morphological variability. The fluidal Cms strains were more reliably identified using DAS-ELISA and BIOLOG System than less fluidal strains.

Czech name

Spolehlivost diagnostických technik pro Erwinia amylovora a Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

Czech description

Erwinia amylovora (Ea), původce spály růžovitých rostlin a Clavibacter michiganensis subsp. sepedoniciis (Cms), původce kroužkovitosti bramboru, patří ke karanténním organismům. Porovnávala se detekce a determinace obou patogenů pomocí různých diagnostických metod. Komerční MAb byly použity pro Cms a PAb pro Ea. Všechny Ea kmeny byly spolehlivě identifikovány pomocí PCR po optimalizaci PCR protokolu a systémem BIOLOG. PTA-ELISA a IIF byly méně spolejlivé kvůli křížových reakcím bakterií doprovázejícíchEa v hostitelských rostlinách. Všechny Cms kmeny byly spolehlivě identifikovány pomocí IIF a PCR bez ohledu na morfologickou variabilitu. Fluidní kmeny Cms byly spolehlivěji identifikovány pomocí DAS-ELISA a systému BIOLOG než nefluidní.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Zemdirbyste-Agriculture

ISSN

1392-3196

e-ISSN

—

Volume of the periodical

95

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

LT - LITHUANIA

Number of pages

7

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000259827600038

EID of the result in the Scopus database

—