A kit for the diagnosis of bovine TLR8 antiviral gene variants
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F18%3AN0000044" target="_blank" >RIV/00027014:_____/18:N0000044 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://vuzv.cz/_privat/18044.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/18044.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Sada pro diagnostiku variant antivirového genu TLR8 skotu
Original language description
Řešení se týká sady reakcí pro diagnostiku variant genu TLR8 u mléčného skotu. Význam genu TLR8 je určen tím, že se podílí na rané imunitě proti virovým původcům chorob skotu. Oblast techniky lze obecně označit jako veterinární DNA diagnostiku. Sada reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Podkladem pro řešení bylo bioinformatické a populačně genetické vyhodnocení variability v imunitních genech TLR u dojeného skotu. V druhé části vývoje potom návrh oligonukleotidových primerů pro genotypovací reakce a jejich optimalizace. Ucelená sada reakcí se zaměřuje na ty genetické polymorfismy, které se vyskytují ve středoevropské populaci dojeného skotu, a dosahuje tak úspor prováděných reakcí. Sada tudíž odstraňuje nedostatky dosavadních metod pro tuto skupinu TLR a přidává hodnotu optimalizace pro danou populaci. Výběr SNP vychází ze zastoupení polymorfismů v reprezentativních plemenech česká červinka a český strakatý skot. Součástí navrženého řešení je také optimalizace podmínek pro souběžné provádění sdružených genotypovacích reakcí ve skupinách (multiplexech) 5 a 6 reakcí, což umožňuje snížit výrazně náklady i pracnost metody.
Czech name
Sada pro diagnostiku variant antivirového genu TLR8 skotu
Czech description
Řešení se týká sady reakcí pro diagnostiku variant genu TLR8 u mléčného skotu. Význam genu TLR8 je určen tím, že se podílí na rané imunitě proti virovým původcům chorob skotu. Oblast techniky lze obecně označit jako veterinární DNA diagnostiku. Sada reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Podkladem pro řešení bylo bioinformatické a populačně genetické vyhodnocení variability v imunitních genech TLR u dojeného skotu. V druhé části vývoje potom návrh oligonukleotidových primerů pro genotypovací reakce a jejich optimalizace. Ucelená sada reakcí se zaměřuje na ty genetické polymorfismy, které se vyskytují ve středoevropské populaci dojeného skotu, a dosahuje tak úspor prováděných reakcí. Sada tudíž odstraňuje nedostatky dosavadních metod pro tuto skupinu TLR a přidává hodnotu optimalizace pro danou populaci. Výběr SNP vychází ze zastoupení polymorfismů v reprezentativních plemenech česká červinka a český strakatý skot. Součástí navrženého řešení je také optimalizace podmínek pro souběžné provádění sdružených genotypovacích reakcí ve skupinách (multiplexech) 5 a 6 reakcí, což umožňuje snížit výrazně náklady i pracnost metody.
Classification
Type
F<sub>uzit</sub> - Utility model
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2018
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Patent/design ID
31486
Publisher
CZ001 -
Publisher name
Industrial Property Office
Place of publication
Prague
Publication country
CZ - CZECH REPUBLIC
Date of acceptance
—
Owner name
Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.
Method of use
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel
Usage type
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)