Kit for diagnosing bovine MYD88 gene variants
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F19%3AN0000078" target="_blank" >RIV/00027014:_____/19:N0000078 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0032/uv032890.pdf" target="_blank" >https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0032/uv032890.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Sada reakcí pro diagnostiku variant genu MYD88 skotu
Original language description
Řešení se vztahuje k postupu pro laboratorní určování strukturních variant genu MYD88 u skotu. Gene MYD88 kóduje myeloidní diferenciační faktor 88 (MyD88), klíčovou složku systému přirozené imunity, která působí na začátku Toll signální dráhy od receptorů přirozené imunity ze skupiny Toll-like receptorů. Proto mohou přirozeně se vyskytující varianty genu MYD88 ovlivnit účinnost rozpoznávání patogenů a kinetiku imunitní odpovědi. V rámci užitného vzoru byla vyřešena strukturní obtížnost tohoto genu pro PCR amplifikaci, proběhl návrh reakcí a optimalizace skupin (multiplexů), v nichž jsou reakce prováděny souběžně po 5 až 7 pro snížení pracnosti a nákladů. Návrh sady reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Řešení rovněž vycházelo ze zjištěného zastoupení jednotlivých genových variant ve středoevropské populaci mléčného skotu, jmenovitě u plemene český strakatý skot. Sada tak poskytuje možnost určit u jednotlivých zvířat většinu variant genu MYD88 vyskytujících se v dané populaci skotu, a to v minimálním počtu samostatných reakčních objemů. Sada reakcí také zahrnuje polymorfismy s diagnostickým významem pro předpověď dodatečných polymorfismů ve skupinách s genetickou vazbou, tzv. haplotypech.
Czech name
Sada reakcí pro diagnostiku variant genu MYD88 skotu
Czech description
Řešení se vztahuje k postupu pro laboratorní určování strukturních variant genu MYD88 u skotu. Gene MYD88 kóduje myeloidní diferenciační faktor 88 (MyD88), klíčovou složku systému přirozené imunity, která působí na začátku Toll signální dráhy od receptorů přirozené imunity ze skupiny Toll-like receptorů. Proto mohou přirozeně se vyskytující varianty genu MYD88 ovlivnit účinnost rozpoznávání patogenů a kinetiku imunitní odpovědi. V rámci užitného vzoru byla vyřešena strukturní obtížnost tohoto genu pro PCR amplifikaci, proběhl návrh reakcí a optimalizace skupin (multiplexů), v nichž jsou reakce prováděny souběžně po 5 až 7 pro snížení pracnosti a nákladů. Návrh sady reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Řešení rovněž vycházelo ze zjištěného zastoupení jednotlivých genových variant ve středoevropské populaci mléčného skotu, jmenovitě u plemene český strakatý skot. Sada tak poskytuje možnost určit u jednotlivých zvířat většinu variant genu MYD88 vyskytujících se v dané populaci skotu, a to v minimálním počtu samostatných reakčních objemů. Sada reakcí také zahrnuje polymorfismy s diagnostickým významem pro předpověď dodatečných polymorfismů ve skupinách s genetickou vazbou, tzv. haplotypech.
Classification
Type
F<sub>uzit</sub> - Utility model
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QJ1610489" target="_blank" >QJ1610489: Occurence of genetic factors for infection resistance in selected breeds of dairy cattle</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Patent/design ID
32890
Publisher
CZ001 -
Publisher name
Industrial Property Office
Place of publication
Prague
Publication country
CZ - CZECH REPUBLIC
Date of acceptance
—
Owner name
VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI
Method of use
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel
Usage type
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)