PCR kit for DNA determination of anglerfish (Lophius pisactorius)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027022%3A_____%2F22%3A1137" target="_blank" >RIV/00027022:_____/22:1137 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

PCR souprava pro stanovení DNA ryby ďase mořského (Lophius piscatorius)

Original language description

Standardně bývají pro identifikaci druhů pomocí PCR používány markery na mitochondriích typu cytochrom-oxidázy. V předkládaném funkčním vzorku byl však pro druhové stanovení komponenty rybího masa zaveden marker genomový, a to v oblasti druhého intronu protein-kódující části parvalbuminového genu. Jedná se tak o nový přístup k průkazu přítomnosti rybího masa. Zavedení nového markeru v oblasti intronu jaderného genu umožňuje spolehlivě odlišit jednotlivé druhy ryb. Na rozdíl od exonových oblastí, které jsou vysoce konzervované v důsledku selekčního tlaku na intaktnost struktury translací vzniklého proteinu, záměna pořadí aminokyselin u intronů cíleně odstraňována není a vzniklé mutace se tak hromadí. V důsledku toho se introny odlišují i mezi blízce příbuznými druhy a jsou tak vhodné pro použití jako druhový marker pro detekci pomocí PCR. Předkládaný funkční vzorek je pak praktickou úrovní vývoje této metody, kde je pomocí PCR určován konkrétní druh ryby – ďas mořský. Ďas mořský patří k vybraným rybím delikatesám; dostupný je i na českém trhu. Jeho praktické stanovení proto není čistě akademickou otázkou. Funkční vzorek tak může najít rozsáhlé praktické uplatnění, a to i díky tomu že PCR ve formátu endpoint je dnes již robustní metodou s relativně malými nároky na vybavení laboratoře.

Czech name

PCR souprava pro stanovení DNA ryby ďase mořského (Lophius piscatorius)

Czech description

Standardně bývají pro identifikaci druhů pomocí PCR používány markery na mitochondriích typu cytochrom-oxidázy. V předkládaném funkčním vzorku byl však pro druhové stanovení komponenty rybího masa zaveden marker genomový, a to v oblasti druhého intronu protein-kódující části parvalbuminového genu. Jedná se tak o nový přístup k průkazu přítomnosti rybího masa. Zavedení nového markeru v oblasti intronu jaderného genu umožňuje spolehlivě odlišit jednotlivé druhy ryb. Na rozdíl od exonových oblastí, které jsou vysoce konzervované v důsledku selekčního tlaku na intaktnost struktury translací vzniklého proteinu, záměna pořadí aminokyselin u intronů cíleně odstraňována není a vzniklé mutace se tak hromadí. V důsledku toho se introny odlišují i mezi blízce příbuznými druhy a jsou tak vhodné pro použití jako druhový marker pro detekci pomocí PCR. Předkládaný funkční vzorek je pak praktickou úrovní vývoje této metody, kde je pomocí PCR určován konkrétní druh ryby – ďas mořský. Ďas mořský patří k vybraným rybím delikatesám; dostupný je i na českém trhu. Jeho praktické stanovení proto není čistě akademickou otázkou. Funkční vzorek tak může najít rozsáhlé praktické uplatnění, a to i díky tomu že PCR ve formátu endpoint je dnes již robustní metodou s relativně malými nároky na vybavení laboratoře.

Type

G_funk - Functional sample

CEP classification

—

OECD FORD branch

40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)

Project

<a href="/en/project/QK1910231" target="_blank" >QK1910231: New approaches for the proof of fish meat adulteration using genomic DNA</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

1137

Numerical identification

—

Technical parameters

Smlouva nebyla dosud uzavřena.

Economical parameters

PCR souprava se dosud nevyrábí.

Application category by cost

—

Owner IČO

00027022

Owner name

Výzkumný ústav potravinářský Praha, v.v.i.

Owner country

CZ - CZECH REPUBLIC

Usage type

O - Doposud nevyužívaný výsledek

Licence fee requirement

N - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

Web page

—