A PCR-based method for the detection of genetically modified potatoes by the gene ac2 from Amaranthus caudatus

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F06%3A%230000058" target="_blank" >RIV/00027162:_____/06:#0000058 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

A PCR-based method for the detection of genetically modified potatoes by the gene ac2 from Amaranthus caudatus

Original language description

Most of the scientific papers concerning genetically modified organisms (GMO) are focused on the publication of the detection protocols for GM corn, soyabean, rape or cotton. Minor modifications, such as potatoes, attract little attention. This work wasbased on developing an easy and cheap PCR method for the detection of the ac2 gene, encoding an antimicrobial peptide from amaranth, which was used for transformation of potatoes. The method was based on duplex PCR which enabled identification of both potato and amaranth specific genes in one tube. The method was enhanced by using positive plasmid controls which were able to reveal presence of inhibitors, reduce the incidence of false negative results, and wrong interpretation during analysis of routinesamples. PCR sensitivity using plasmid DNA was determined to be one molecule per reaction. The system was used to find the ac2 gene in 14 variants of potatoes, which were all negative for the inserted ac2 gene from amaranth.

Czech name

Identifikace geneticky modifikovaných brambor amplifikací genu ac2 z Amaranthus caudatus

Czech description

Většina vědeckých prací na poli geneticky modifikovaných organismů (GMO) prezentuje detekční metody pro identifikaci GM kukuřice, sóji, řepky nebo bavlny. Ostatním modifikacem, jako jsou např. brambory, je věnována jen menší pozornost. Cílem této práce bylo vyvinout jednoduchou a levnou PCR metodu pro detekci ac2 genu kódujícího antimikrobní peptid z amarantu, který byl použit pro transformaci bramboru. Podstatou metody byla duplex PCR, která umožňovala identifikaci jak ac2 genu, tak specifického genu bramboru v jedné reakci. Součástí metodiky byly také plazmidové pozitivní kontroly, které sloužily pro odhalení přítomnosti PCR inhibitorů, falešně pozitivních výsledků a chybné interperetace výsledků během rutinní analýzy. Citlivost metodiky byla testována na plazmidových řadách a byla stanovena na jednu molekulu na reakci. Systém byl otestován na 14 odrůdách bramboru, které byly, pro gen ac2, negativní.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

European Food Research and Technology

ISSN

1438-2377

e-ISSN

—

Volume of the periodical

—

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

4

Pages from-to

1

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—