Identification of putative ancestors of the multidrug-resistant Salmonella enterica serovar typhimurium DT104 clone harboring the Salmonella genomic island 1

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F07%3A%230000179" target="_blank" >RIV/00027162:_____/07:#0000179 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216224:14310/07:00050770

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Identification of putative ancestors of the multidrug-resistant Salmonella enterica serovar typhimurium DT104 clone harboring the Salmonella genomic island 1

Original language description

Origin of multidrug-resistant S. typhimurium harboring the SGI1 is unknown. In this study, we performed microarray genomotyping of four multidrug-resistant SGI1 positive strains and found that unlike the S. typhimurium LT2 strain, the multidrug-resistantstrains lacked genes STM0517-0529. We extended this observation by PCR screening of additional 120 S. typhimurium field strains and found that this locus was absent in all SGI1 positive and also in 24% of SGI1 negative strains which were proposed to bethe original recipients of SGI1. To prove this hypothesis, we compared the STM0517-0529 negative strains (with or without the SGI1) by PFGE and PCR prophage typing and found that 8 out of 11 of the SGI1 negative strains and 17 out of 22 SGI1 positive strains were of identical PFGE pattern and PCR prophage pattern. We therefore proposed that a lineage of the S. typhimurium DT104 sensitive strain first lost STM0517-0529 genes and then acquired SGI1.

Czech name

Identifikace předchůdců multirezistentních kmenů Salmonella enterica serovar Typhimurium fágového typu DT104

Czech description

Původ multirezistentních SGI1 pozitivních kmenů S. Typhimurium není znám. V této práci jsme pomocí microarray analýzy zjistili, že na rozdíl od kmene LT2, 4 SGI1 pozitivní kmeny fágového typu DT104 neměly ve svém genomu geny STM0517-0524. Toto pozorováníjsme rozšířili pomocí PCR na dalších 120 kmenů a zjistili jsme, že tento lokus chyběl u všech SGI1 pozitivních kmenů a taky u 24% kmenů bez SGI1. Předpokládali jsme, že STM0517-0529 a zároveň SGI1 negativní jsou původními recipienty SGI1. Abychom to prokázali, obě skupiny kmenů jsme dále porovnali pomocí PFGE a PCR profágové typizace. Zjistili jsme, že obě skupiny kmenů jsou si velmi podobné i v těchto testech, což nám umožnilo navrhnout nedávnou evoluci multirezistentních kmenů S. Typhimurium, kdy nejprve kmen citlivý k antibiotikům ztratil geny STM0517-0529 a následně získal SGI1.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Archives of Microbiology

ISSN

0302-8933

e-ISSN

—

Volume of the periodical

187

Issue of the periodical within the volume

5

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

10

Pages from-to

415-424

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—