Method for isolation and detection of African Swine Fever Virus DNA from meat and meat products
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000117" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000117 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metoda izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků
Original language description
Pro průkaz viru afrického moru prasat v mase a masných výrobcích je nutná jeho spolehlivá detekce. Molekulární detekce pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR) představuje citlivou metodu, s možností kvantifikace virové nálože ve vzorku. Pro tento účel je důležité získat nukleovou kyselinu odpovídající koncentrace a čistoty. Představovaná metoda, kombinace fenol-chloroformové extrakce nukleové kyseliny a izolace s využitím magnetických mikročástic, poskytuje z komplexních matric masa a masných výrobků nukleovou kyselinu požadované čistoty. Následná detekce cílové sekvence vykazuje limit detekce 400 kopií DNA ve vzorku.
Czech name
Metoda izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků
Czech description
Pro průkaz viru afrického moru prasat v mase a masných výrobcích je nutná jeho spolehlivá detekce. Molekulární detekce pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR) představuje citlivou metodu, s možností kvantifikace virové nálože ve vzorku. Pro tento účel je důležité získat nukleovou kyselinu odpovídající koncentrace a čistoty. Představovaná metoda, kombinace fenol-chloroformové extrakce nukleové kyseliny a izolace s využitím magnetických mikročástic, poskytuje z komplexních matric masa a masných výrobků nukleovou kyselinu požadované čistoty. Následná detekce cílové sekvence vykazuje limit detekce 400 kopií DNA ve vzorku.
Classification
Type
G<sub>funk</sub> - Functional sample
CEP classification
—
OECD FORD branch
10607 - Virology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1920113" target="_blank" >QK1920113: African swine fever virus in meat and products thereof – detection methods and persistence studies</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
B0003
Numerical identification
Funkční vzorek 5704/2019
Technical parameters
Technické řešení „Metody izolace a detekce DNA viru afrického moru prasat v matricích masa a masných výrobků“ je založeno na kombinaci fenol-chloroformové extrakce DNA a izolace na magnetických kuličkách. Izolovaná DNA je detekována metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce v reálném čase (qPCR). Použití kombinace fenol-chloroformové extrakce nukleové kyseliny umožní zredukovat pracovní činnost v prostorách laboratoří bezpečnostního stupně 3 a koncová izolace s použitím komerční soupravy může být v budoucnu automatizována, čím se může zajistit zpracovávání většího množství vzorků, snížení pracnosti metody a její urychlení.
Economical parameters
V současné době nelze ekonomické aspekty odhadnout Náklady na zavedení metodiky do laboratoře se týkají pořízení spotřebního materiálu, chemikálií, souprav pro izolaci nukleových kyselin, provedení qPCR a syntézu oligonukleotidů. Náklady na materiál na vyšetření jednoho vzorku (bez DPH) se pohybují kolem 680 Kč za vzorek, a to včetně použití standardů a kontrol.
Application category by cost
—
Owner IČO
00027162
Owner name
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence
Licence fee requirement
A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek
Web page
https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5704-Krizankova-Met_izol_a_det_DNA_viru_afr_moru_prasat_v_matr_masa_a_mas_vyr.pdf