Genetic diversity of Paenibacillus larvae isolates in the territory of the Czech Republic and the adjacent part of Slovakia
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F23%3AN0000027" target="_blank" >RIV/00027162:_____/23:N0000027 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Genetická diverzita izolátů Paenibacillus larvae na území České republiky a přilehlé části Slovenska
Original language description
Cílem práce bylo analyzovat kmeny Paenibacillus larvae vyskytující se na území České republiky v letech 2016-2017 a charakterizovat genetickou strukturu jejich populace s využitím genotypizace ERIC, multilokusové sekvenční typizace (MLST) a analýzy celogenomové sekvence (WGS). Výsledky byly doplněny analýzou izolátů odebraných v roce 2018 v oblastech Slovenska nacházejících se v blízkosti česko-slovenské hranice. Genotypizace ERIC odhalila, že 78,9 % testovaných izolátů patřilo do genotypu ERIC II a 21,1 % do genotypu ERIC I. MLST ukázal šest sekvenčních typů, přičemž ST10 a ST11 byly mezi izoláty nejčastější. U šesti izolátů jsme našli nesrovnalost v korelaci mezi genotypem MLST a ERIC. MLST a WGS analýza izolátů odhalila, že každá ze dvou geografických oblastí s vysokým výskytem moru včelího plodu měla své vlastní dominantní kmeny P. larvae. Předpokládáme, že tyto kmeny představovaly primární zdroje infekce v postižených oblastech. Kromě toho byla v geograficky vzdálených oblastech odhalena sporadická přítomnost kmenů identifikovaných porovnáním celogenomových sekvencí jako geneticky příbuzné, což naznačuje možný přenos P. larvae zprostředkovaný člověkem.
Czech name
Genetická diverzita izolátů Paenibacillus larvae na území České republiky a přilehlé části Slovenska
Czech description
—
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
40301 - Veterinary science
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů