Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00013780" target="_blank" >RIV/00216224:14310/05:00013780 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.

Original language description

A set of reference strains and a group of previously unidentified enterococci were analysed by rep-PCR with the (GTG)5 primer to evaluate the discriminatory power and suitability of this method for typing and identification of enterococcal species. A total of 49 strains representing all validly described species were obtained from bacterial collections. For more extensive evaluation of this identification approach 112 well-defined and identified enterococci isolated from bryndza cheese were tested. The(GTG)5-PCR fingerprinting assigned all strains into well-differentiated clusters representing individual species. Subsequently, a group including 44 unidentified enterococci isolated from surface waters was analysed to evaluate this method for identification of unknown isolates. Obtained band patterns allowed us to identify all the strains clearly to the species level. This study proved that rep-PCR with (GTG)5 primer is a reliable and fast method for species identification of enterococc

Czech name

Využití (GTG)5-PCR pro identifikaci Enterococcus spp.

Czech description

Skupina referenčních a neidentifikovaných kmenů enterokoků byla analyzována rep-PCR s (GTG)5 primerem pro zjištění rozlišovaní schopnosti a vhodnosti této metody pro typizaci a identifikaci druhů enterokoků. Celkem 49 kmenů reprezentujících všechny doposud popsané druhy enterokoků bylo získáno z bakteriálních sbírek. Pro spolehlivější ověření tohoto identifikačního přístupu bylo dále testováno 112 dobře charakterizovaných enterokoků izolovaných z bryndzy. Výsledky (GTG)5-PCR zařadily všechny kmeny do jasně oddělených skupin reprezentujících jednotlivé druhy. Následně byla metoda použita pro identifikaci 44 blíže neurčených kmenů enterokoků izolovaných z povrchových vod. Získané výsledky jasně zařadily tyto kmeny do jednotlivých druhů. Tato studie prokázala, že rep-PCR s (GTG)5 primerem je vhodná a rychlá metoda pro druhovou identifikaci enterokoků.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

FEMS Microbiology Letters

ISSN

0378-1097

e-ISSN

—

Volume of the periodical

247

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

5

Pages from-to

59-63

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—