Isolation of microbial DNA by newly designed magnetic particles
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00015958" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00015958 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/61389013:_____/06:00041858
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Isolation of microbial DNA by newly designed magnetic particles
Original language description
Carboxyl group-containing magnetic nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-glycidyl methacrylate) (P(HEMA-co-GMA)) microspheres and cobalt ferrite nanoparticles modified with alginic acid (natural carboxylic polysaccharide) were used for isolationof microbial DNA of lactic acid bacteria (LAB) and Trichophyton fungi DNA from lyophilized samples, from a bacterial colony grown on hard media, and from dairy products. DNA from the samples with lysed cells was reversibly adsorbed to the particles in the presence of high poly(ethylene glycol) (PEG 6000) and sodium chloride concentrations. The optimal final PEG and NaCl concentrations were 9.1 wt. % and 2.0 M, respectively. The adsorbed DNA was released from the particles in low ionic strength TE buffer. The quality of isolated DNA was checked by PCR amplification. Moreover, PCR amplicons were isolated on P(HEMA-co-GMA) microspheres and checked by restriction analysis.
Czech name
Izolace mikrobální DNA pomocí nově navržených magnetických částic
Czech description
Magnetické, neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-glycidyl methakrylát) (P(HEMA-co-GMA))mikročástice obsahující karboxylové skupiny a kobalt feritové nanočástice, modifikované kyselinou alginovou (přirozený polysacharid s karboxylovými skupinami),byly použity k izolaci mikrobiální DNA z bakterií mléčného kvašenía DNA z houby Trichophyton z lyofilyzovaných vzorků, bakteriálních kolonií rostoucích na pevných mediích a z mléčných výrobků.DNA izolovaná z lyzovaných buněk byla reverzibilně adsorbována na částice v přítomnosti vysoké koncentrace poly(ethylen glykolu)(PEG 6000) a chloridu sodného. Optimální konečné koncentrace PEG a NaCl byly 9,1 % a 2,0 M. Adsorbovaná DNA eluována z částic pomocí TE pufru. Kvalita izolované DNA byla ověřena pomocí amplifikace v PCR.Mimoto byly pomocí P(HEMA-co-GMA))mikročástic izolány amplikony PCR, které byly použity pro restrikční analýzu.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EE - Microbiology, virology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Colloids and Surfaces B: Biointerferences
ISSN
0927-7765
e-ISSN
—
Volume of the periodical
52
Issue of the periodical within the volume
2
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
6
Pages from-to
143-148
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—