Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00016161" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00016161 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/61389013:_____/06:00042452
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
Original language description
Carboxyl group-containing magnetic nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-ethylene dimethacrylate) (P(HEMA-co-EDMA)) microspheres were used for the isolation of polymerase chain reaction(PCR)-ready DNA from samples of Baikal sediments. The occurence of false -negative results in PCR caused by the presence of extracelular inhibitors in DNA samples was solved using solid phase reversible DNA immobilisation. PCR-ready DNA was reversibly adsorbed to the microspheres in the presence of 8.0% PEG 6000 and 2.0 M sodium chloride concentrations. The adsorbed DNA was released from the microspheres in a low ioninic strength TE buffer. The quality of isolated DNA was checked by PCR amplification.
Czech name
Izolace DNA v kvalitě vhodné pro PCR ze sedimentů Bajkalského jezera pomocí magnetických pomerních částic funkcionalizovaných karboxylovými skupinami
Czech description
Magnetické neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-ethylen dimethakrylát) (P(HEMA-co-EDMA)) mikročástice byly použity k izolaci DNA z bajkalských sedimentů v kvalitě vhodné pro PCR. Výskyt falešně negativních výsledků v PCR byl způsoben přítomnostíextracelulárních inhibitorů ve vzorcích DNA. K jejich odstranění byla použita metoda reversibilní imobilizace DNA. DNA byla reversibilně adsorbována na mikročástice v přítomnosti 8,0% PEG 6000 a 2,0 m NaCl. Adsorbovaná DNA byla eluována TE pufrem o nízkéiontové síle. Kvalita izolované DNA byla ověřována pomocí PCR.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EE - Microbiology, virology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA203%2F05%2F2256" target="_blank" >GA203/05/2256: Magnetic stimuli-responsive hydrophilic polymer microspheres for biomedicine/bioengineering</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Journal of Chromatography A
ISSN
0021-9673
e-ISSN
—
Volume of the periodical
1130
Issue of the periodical within the volume
1
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
7
Pages from-to
115-121
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—