The levels of miR-210 in tumor tissue and function of this miRNA in renal cell carcinoma
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F12%3A00064923" target="_blank" >RIV/00216224:14740/12:00064923 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Hladiny miR-210 v nádorové tkáni a funkční efekty jejího utlumení na buňky renálního karcinomu
Original language description
Renální karcinom (RCC) je nejčastější nádorové onemocnění ledvin v dospělém věku čítající asi 3 % dospělých malignit. MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující jednovláknové RNA, které regulují genovou expresi na post-transkripční úrovni. Za použití qRT-PCR TaqMan low density array (TLDA) jsme analyzovali globální expresní profily miRNA u RCC a u nenádorového renálního parenchymu. Získaná data byla normalizována (RNU48, RNU6B) a poté statisticky vyhodnocena v prostředí statistického jazka R pomocí programu Bioconductor v kombinaci s hierarchickým klastrováním. Získaná data jsme dále validovali na nezávislém souboru pacientů. In vitro experimenty byly prováděny na buněčných liniích renálního karcinomu ACHN a CAKI-2, kde jsme analyzovali vliv transfekce anti-miR-210 na životaschopnost buněk, apoptózu, buněčný cyklus, migraci a invazivitu.
Czech name
Hladiny miR-210 v nádorové tkáni a funkční efekty jejího utlumení na buňky renálního karcinomu
Czech description
Renální karcinom (RCC) je nejčastější nádorové onemocnění ledvin v dospělém věku čítající asi 3 % dospělých malignit. MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující jednovláknové RNA, které regulují genovou expresi na post-transkripční úrovni. Za použití qRT-PCR TaqMan low density array (TLDA) jsme analyzovali globální expresní profily miRNA u RCC a u nenádorového renálního parenchymu. Získaná data byla normalizována (RNU48, RNU6B) a poté statisticky vyhodnocena v prostředí statistického jazka R pomocí programu Bioconductor v kombinaci s hierarchickým klastrováním. Získaná data jsme dále validovali na nezávislém souboru pacientů. In vitro experimenty byly prováděny na buněčných liniích renálního karcinomu ACHN a CAKI-2, kde jsme analyzovali vliv transfekce anti-miR-210 na životaschopnost buněk, apoptózu, buněčný cyklus, migraci a invazivitu.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
FD - Oncology and haematology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/NT13547" target="_blank" >NT13547: Study od epithelial-to-mesenchymal transition associated microRNAs and genes as potential markers for prediction of risk and early detection of metastatic disease in renal cell carcinoma patients</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2012
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů