PhyloGenSig - Software for construction phylogram from genomic signals

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F13%3APR26845" target="_blank" >RIV/00216305:26220/13:PR26845 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty" target="_blank" >http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
čeština
Original language name
PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů
Original language description
Program umožňuje konvertovat DNA sekvence na genomické signály, provést kompresi pro extrémně dlouhé signály (celogenomové průběhy), zarovnat signály pomocí DTW, vyhodnotit jejich podobnost a sestrojit fylogram.
Czech name
PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů
Czech description
Program umožňuje konvertovat DNA sekvence na genomické signály, provést kompresi pro extrémně dlouhé signály (celogenomové průběhy), zarovnat signály pomocí DTW, vyhodnotit jejich podobnost a sestrojit fylogram.

Project
<a href="/en/project/GAP102%2F11%2F1068" target="_blank" >GAP102/11/1068: Nano-Electro-Bio-Tools for Biochemical and Molecularly-Biological Studies of Eukaryotic Cells (NanoBioTECell)</a><br>
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year
2013
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID
PhyloGenSig
Technical parameters
Software byl realizován jako výsledek projektu GAČR GD102/09/H083: Informační technologie v biomedicínském inženýrství. Produkt je využíván na VUT v Brně, na Mendelově univerzitě v Brně a Centrem pokročilých studií Fakulty vojenského zdravotnictví Univerzity obrany v Hradci Králové. Pro spuštění je zapotřebí Matlab R2011a (nebo vyšší verze) + Bioinformatics toolbox.
Economical parameters
cena 50.000,- Kč
Owner IČO
00216305
Owner name
Ústav biomedicínského inženýrství

Similar results(10)